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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】请教专业术语的含义
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huairpan

木虫 (正式写手)

很牛

[交流] 【求助】请教专业术语的含义

如题，刚刚接触分子对接，对下面这几个术语不了解：
cluster
density
pose
solvent accessible surface
去溶剂化
能够帮忙详细的解释一下吗，多谢！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:54 ]
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我思故我在
1楼 2009-07-07 14:52:41
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recoli

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢！ 7-7 19:48
术语也是需要上下文的啊
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2楼2009-07-07 15:02:14
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huairpan

木虫 (正式写手)

很牛
都是关于分子对接的术语
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我思故我在
3楼2009-07-07 15:15:34
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢！ 7-7 19:49
肯定得有上下文才好定义。比如：cluster用在计算机里叫集群。用在化学里就可能叫“簇”了。
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4楼2009-07-07 15:46:45
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 7-10 10:56
引用回帖:
Originally posted by huairpan at 2009/7/7 14:52:
如题，刚刚接触分子对接，对下面这几个术语不了解：
cluster
density
pose
solvent accessible surface
去溶剂化
能够帮忙详细的解释一下吗，多谢！

[ Last edited by huairpan on 2009-7-7 at 15:14 [ ...

呵呵，cluster应该只在autodock中用，其代表的含义是rmsd在一个 上下容差范围内的聚类的意思。

density应无对接中的特殊用法，就是密度聚集度等基本含义

pose就是构象的意思

solvent accessible surface为溶剂可及化表面，应该就是所谓的范德华表面
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个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
5楼2009-07-07 19:52:07
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