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11900490

木虫 (知名作家)

[交流] SIR2004的安装,晶体解析和和RES文件保存

SIR2004安装

图1:如图打开WinGX,找到一个具体数据Project-->Start/Select New Project会出现一个对话框,点击Browse...找到想要解决的晶体数据的ins文件。
图2:SIR2004安装。直接点击安装文件,一路点击下一步,直接安装到默认目录下C:\Program Files\Sir2004就可以。如果没有按照到默认目录C:\Program Files\Sir2004下就要设置环境变量。


SIR2004挂载

图3:SIR2004挂载。打开WinGX的File-->System-->Application,
图4:选择第二个选项卡Plugin2。
图5:这时我们看到SIR-2004的挂载选项框,点击“Browse...”然后找到安装目录C:\Program Files\Sir2004下的Sir2004的图标,选择后单击打开。
图6:挂载选项框就会出现“c:\program files\sir2004\sir2004.exe”然后点击“OK”就可以了。至此挂载完毕。


SIR2004解析晶体

图7:重启WinGX,打开菜单栏上的“Solve”菜单这,可以看到SIR-2004的选项。
图8:我们选择“GUI Control”,就会出现“SIR-2004 Control Panel”,显示的是晶胞参数和衍射数据。点击“OK”。
图9:这时WinGX会调用SIR-2004,出现三个窗口,一个是SIR-2004主窗口,一个是“Wilson Plot”,如果“Wilson Plot”的两条线吻合的很好,说明数据很好,结构很容易解出来。最后一个是“FOMs”。
图10:SIR-2004会寻找最好的结果显示出来,如果SIR-2004找到了,就会出现如图10的恭喜提示,如果没有找到最好的结构不会出现这个恭喜提示的,而且还会找很长时间,个别情况会找一两个小时。


SIR-2004结果的保存

图11:SIR-2004结果的保存。我们用的是WinGX或者ShelxTL,需要将结果保存为res文件,你要以便后续处理。打开SIR-2004的File-->Export-->Shelx(*.res)。
图12:如图会看到这个提示保存成功。
图13:退出SIR-20004。点击File下面的退出按钮,选择“Yes”退出SIR-2004。
图14:打开WinGX的图形显示界面就会看到刚刚在SIR-2004的结构。

SIR-2004的功能不止这些,这里只是抛砖引玉。


[ Last edited by 11900490 on 2009-7-7 at 02:02 ]
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11900490

木虫 (知名作家)

引用回帖:
Originally posted by staphlee at 2009/7/7 08:16:
一開始我也想要學sir2004, 不過後還轉戰 SHELXTL 了
現在還在學

在WinGX下面很多东西比SHELXTL要有很大的优势,一般的初学者用SHELXTL但是牛人都是用WinGX的
5楼2009-07-07 08:53:16
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fox377

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我的晶体,sir2004运行了3天也没有解出来。最后给我5个phase。郁闷啊!cell是cubic I
2楼2009-07-07 07:57:26
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11900490

木虫 (知名作家)

引用回帖:
Originally posted by fox377 at 2009/7/7 07:57:
我的晶体,sir2004运行了3天也没有解出来。最后给我5个phase。郁闷啊!cell是cubic I

这主要是你的数据不好。
3楼2009-07-07 07:58:35
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staphlee

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
一開始我也想要學sir2004, 不過後還轉戰 SHELXTL 了
現在還在學
4楼2009-07-07 08:16:31
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