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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 致癌基因与抑癌基因的判断是怎样的？
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

[求助] 致癌基因与抑癌基因的判断是怎样的？ 已有2人参与

我在读文献时，遇到一些问题。致癌基因和抑癌基因。
比如p53是典型的抑癌基因，它可以调控细胞凋亡。
那么在生信分析过程中，做了转录注测序，癌症 vs 癌旁。找到了差异基因。
怎么判断，这些差异基因中，哪些是致癌基因，哪些是抑癌基因？
通过表达趋势判断吗？
还是通过参与的通路判断？

或是，没办法通过生信的方法预测？
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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭
1楼 2020-04-16 11:03:01
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毛毛雨0328

捐助贵宾 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
顾名思义，在癌组织里表达高自然是致癌基因，反之则是抑癌基因，除非发生变异。IPA里有个上游分析，对找到关键基因也会有帮助。
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3楼2020-04-18 11:55:49
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香园白丁

金虫 (小有名气)
你说对了，得自己判断的，转录组只是告诉你哪些基因变化了，可能参与了什么通路和功能，具体的关键基因得自己判断，有问题可以私聊我

发自小木虫Android客户端
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2楼2020-04-16 20:49:48
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soarshining

捐助贵宾 (著名写手)
感觉转录组就只是大数据的表达量而已，而表达的东西本身是什么做用，有哪些相互作用，都需要你提前标注才好分析吧。
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4楼2020-04-23 09:05:54
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

表达量增加时促进癌变的是致癌基因；表达量减少时促进癌变的是抑癌基因。
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5楼2020-06-08 15:39:04
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