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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

[求助] 致癌基因与抑癌基因的判断是怎样的? 已有2人参与

我在读文献时,遇到一些问题。致癌基因和抑癌基因。
比如p53是典型的抑癌基因,它可以调控细胞凋亡。
那么在生信分析过程中,做了转录注测序,癌症 vs 癌旁。找到了差异基因。
怎么判断,这些差异基因中,哪些是致癌基因,哪些是抑癌基因?
通过表达趋势判断吗?
还是通过参与的通路判断?

或是,没办法通过生信的方法预测?
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你,长大了吗?~有目的的希望小木虫不要倒闭
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香园白丁

金虫 (小有名气)

你说对了,得自己判断的,转录组只是告诉你哪些基因变化了,可能参与了什么通路和功能,具体的关键基因得自己判断,有问题可以私聊我

发自小木虫Android客户端
2楼2020-04-16 20:49:48
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毛毛雨0328

捐助贵宾 (初入文坛)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
顾名思义,在癌组织里表达高自然是致癌基因,反之则是抑癌基因,除非发生变异。IPA里有个上游分析,对找到关键基因也会有帮助。
3楼2020-04-18 11:55:49
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soarshining

捐助贵宾 (著名写手)

感觉转录组就只是大数据的表达量而已,而表达的东西本身是什么做用,有哪些相互作用,都需要你提前标注才好分析吧。
4楼2020-04-23 09:05:54
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

表达量增加时促进癌变的是致癌基因;表达量减少时促进癌变的是抑癌基因。
5楼2020-06-08 15:39:04
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