24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1024  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

小x要努力

新虫 (初入文坛)

[求助] 生物信息学问题如何实现根据某一氨基酸序列对其他物种的氨基酸序列进行编号? 已有1人参与

非生物信息学专业,但是做了生物信息学的毕业设计想找大佬请教一下。
想请教一下这个文献当中的,根据牛视紫红质氨基酸对其他物种中的opsin序列进行编号,是什么意思,怎样才能做到?谢谢
文献原文如下:
“得到的候选视蛋白氨基酸序列的用 clustal w软件进行多重序列比对,并根据牛视紫红质氨基酸(lLH, Palczewski等,2000; Teller等,2001)对其他物种中
opsin序列的氨基酸位置进行编号。”
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小x要努力

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by candlelight1 at 2020-03-21 20:05:24
它的意思是做了多重比对,这样就可以得到其它序列和 ref序列的相对位置, 你下载一个 mega 或者 clustalw 软件做多重比对就行了

您好,我还想问一下,因为我现在做的是通过几个功能相同的同源蛋白序列来筛选某个物种中该功能蛋白序列, 在用blast的时候,可以多个同源蛋白放在一个文件当中进行筛选还是要逐个比对?如果是逐个比对,如何对每个同源序列得到的蛋白如何处理,比如是取交集还是并集?

发自小木虫IOS客户端
3楼2020-03-22 20:39:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

candlelight1

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

它的意思是做了多重比对,这样就可以得到其它序列和 ref序列的相对位置, 你下载一个 mega 或者 clustalw 软件做多重比对就行了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2020-03-21 20:05:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冷血孤峰

银虫 (小有名气)

用clustalw操作一下就可以了

发自小木虫IOS客户端
4楼2020-05-19 08:04:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求收留 +5 1943443204 2026-03-28 5/250 2026-03-29 12:11 by 无际的草原
[考研] 318一志愿吉林大学生物与医药 求调剂 +4 笃行致远. 2026-03-28 4/200 2026-03-29 11:55 by longlotian
[考研] 085600,专业课化工原理,321分求调剂 +5 大馋小子 2026-03-28 5/250 2026-03-29 08:56 by qingfeng258
[考研] 305求调剂 +8 RuiFairyrui 2026-03-28 8/400 2026-03-29 08:22 by fmesaito
[考研] 289求调剂 +13 新时代材料 2026-03-27 13/650 2026-03-29 01:16 by 544594351
[考研] 283求调剂 +3 A child 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:41 by ms629
[考研] 药学105500求调剂 +3 Ssun。。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 11:24 by lxf170613
[考研] 085701环境工程求调剂 +9 多久上课 2026-03-27 9/450 2026-03-28 03:58 by fmesaito
[有机交流] 高温高压反应求助 10+4 chibby 2026-03-25 4/200 2026-03-27 21:08 by BT20230424
[考研] 0703化学338求调剂! +6 Zuhui0306 2026-03-26 7/350 2026-03-27 10:35 by shangxh
[考研] 343求调剂 +4 赠我一本书 2026-03-23 4/200 2026-03-27 00:40 by wxiongid
[考研] 327求调剂 +7 prayer13 2026-03-23 7/350 2026-03-26 20:48 by 不吃魚的貓
[考研] 281求调剂 +3 亚克西good 2026-03-26 5/250 2026-03-26 19:48 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分,求调剂 +6 jiajunX 2026-03-22 6/300 2026-03-25 23:05 by licg0208
[考研] 0854AI CV方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-23 4/200 2026-03-25 17:04 by CoderLoser
[考研] 各位老师您好:本人初试372分 +5 jj涌77 2026-03-25 6/300 2026-03-25 14:15 by mapenggao
[考研] 293求调剂 +7 加一一九 2026-03-24 7/350 2026-03-25 12:02 by userper
[考研] 一志愿国科过程所081700,274求调剂 +3 三水研0水立方 2026-03-23 3/150 2026-03-23 23:11 by MajorWen
[考研] 336化工调剂 +4 王大坦1 2026-03-23 5/250 2026-03-23 18:32 by allen-yin
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
信息提示
请填处理意见