应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » Dmol3 中core treatment 设置问题
71/1返回列表
查看: 2229  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

ck12345

新虫 (初入文坛)

[求助] Dmol3 中core treatment 设置问题

计算体系中含有P W C H O元素，选用的DSPP半核赝势，审稿人提的问题是“When pseudopotentials are used (DSPP here for W atoms), the explicit definition of core electrons should be specified." 想请教一下这是什么意思，是W原子的内核电子的定义，这不是软件自己默认选的吗？谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2020-03-08 00:03:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
那你就把你体系W原子芯电子被赝势等效替代的数目写给他就行，这个信息在outmol中可以找到。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

ck12345
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
2楼2020-03-08 10:23:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ck12345

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2020-03-08 10:23:22
那你就把你体系W原子芯电子被赝势等效替代的数目写给他就行，这个信息在outmol中可以找到。

outmol 文件里找到了这些参数，想请教一下是什么意思？
Tungsten     nbas=  5, z=  74, nrfn=  7, rcut=  8.50, e_ref= -0.096192 Ha
  DSPP: PWC_PBE s 01d21 release   rcore=  1.48  zval=  14.00  74.00
赞一下 回复此楼
3楼2020-03-08 12:07:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
3楼: Originally posted by ck12345 at 2020-03-08 12:07:29
outmol 文件里找到了这些参数，想请教一下是什么意思？
Tungsten     nbas=  5, z=  74, nrfn=  7, rcut=  8.50, e_ref= -0.096192 Ha
  DSPP: PWC_PBE s 01d21 release   rcore=  1.48  zval=  14.00  74.00...

nbas指的是基函数类型的编号，z指的是核电荷，nrfn指的是径向函数的数目（但不一定是最终的基函数数目，有些根据基组定义会被去掉），rcut是截断半径（Bohr单位），e_ref是你采用的截断半径和基组计算原子相对于原子在当前理论精度下“精确”的能量之差。
后面的DSPP: PWC_PBE 01d21是赝势的信息，rcore指的是赝势的芯半径，zval后面两个数指的是价电子数目和全电子的核电荷数。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

ck12345
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
4楼2020-03-08 12:49:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ck12345

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 卡开发发 at 2020-03-08 12:49:25
nbas指的是基函数类型的编号，z指的是核电荷，nrfn指的是径向函数的数目（但不一定是最终的基函数数目，有些根据基组定义会被去掉），rcut是截断半径（Bohr单位），e_ref是你采用的截断半径和基组计算原子相对于原 ...

意思就是除了14个电子外，其他的都被做为芯电子处理了是吗？查了W的电子排布式是[Xe]6s2  4f14  5d4 ，那么这个14是从哪来呢？文献里对Pt的描述是：DSPP; density functional semicore pseudopotential DSPP replaces the effects of core electrons (inner than the 4f orbital for Pt) with a simple potential, and includes some degree of relativistic correction)。对于W原子应该怎么描述呢
赞一下 回复此楼
5楼2020-03-12 15:12:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
5楼: Originally posted by ck12345 at 2020-03-12 15:12:43
意思就是除了14个电子外，其他的都被做为芯电子处理了是吗？查了W的电子排布式是6s2  4f14  5d4 ，那么这个14是从哪来呢？文献里对Pt的描述是：DSPP; density functional semicore pseudopotential DSPP replaces  ...

看后面的occ的信息
   n=5  L=0  occ= 2.00 e=      -2.897551Ha       -78.8464eV
   n=5  L=1  occ= 6.00 e=      -1.572247Ha       -42.7830eV
   n=5  L=2  occ= 4.00 e=      -0.147830Ha        -4.0227eV
   n=6  L=0  occ= 2.00 e=      -0.194117Ha        -5.2822eV
   n=5  L=2  occ= 0.00 e=      -0.729681Ha       -19.8556eV
   n=6  L=0  occ= 0.00 e=      -0.707365Ha       -19.2484eV
   n=6  L=1  occ= 0.00 e=      -0.470567Ha       -12.8048eV
occ不为0的表示占据态，其中5s2 5p6 5d4 6s2，这些被认为是价层的组态。
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
6楼2020-03-12 15:59:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huaxuexi111

金虫 (小有名气)
婆婆6nron wohepeies0

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2020-03-22 11:18:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ck12345 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-13 3/150 2026-11-15 05:11 by xSrQNSSjcgoX
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 6/300 2026-11-15 02:59 by xSrQNSSjcgoX
[文学芳草园] 厉娜 +4 张丹枫1991 2026-11-09 6/300 2026-11-15 00:48 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +7 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 10/500 2026-11-15 00:39 by Equinoxhua
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-15 00:24 by Equinoxhua
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-14 20:11 by KXypaGgBBlw7
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 5/250 2026-11-13 11:37 by Equinoxhua
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 1Nb0IVlmV6v0 2026-11-11 4/200 2026-11-13 11:18 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 9/450 2026-11-13 11:02 by Equinoxhua
[考博] 27博士申请（市政/环境） +3 ladf 2026-11-12 3/150 2026-11-13 08:19 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:51 by ECLTXnJnRSXf
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:48 by ECLTXnJnRSXf
[基金申请] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:33 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 9/450 2026-11-12 11:22 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 11:00 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +7 FChKX8meu1ds 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:43 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-12 09:21 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 6/300 2026-11-12 07:09 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 05:19 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 17:03 by TgvkbZZl9tqB
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭