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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » Dmol3 中core treatment 设置问题
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ck12345

新虫 (初入文坛)

[求助] Dmol3 中core treatment 设置问题

计算体系中含有P W C H O元素，选用的DSPP半核赝势，审稿人提的问题是“When pseudopotentials are used (DSPP here for W atoms), the explicit definition of core electrons should be specified." 想请教一下这是什么意思，是W原子的内核电子的定义，这不是软件自己默认选的吗？谢谢
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1楼 2020-03-08 00:03:55
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
那你就把你体系W原子芯电子被赝势等效替代的数目写给他就行，这个信息在outmol中可以找到。
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ck12345
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2楼2020-03-08 10:23:22
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ck12345

新虫 (初入文坛)
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2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2020-03-08 10:23:22
那你就把你体系W原子芯电子被赝势等效替代的数目写给他就行，这个信息在outmol中可以找到。

outmol 文件里找到了这些参数，想请教一下是什么意思？
Tungsten     nbas=  5, z=  74, nrfn=  7, rcut=  8.50, e_ref= -0.096192 Ha
  DSPP: PWC_PBE s 01d21 release   rcore=  1.48  zval=  14.00  74.00
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3楼2020-03-08 12:07:29
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
3楼: Originally posted by ck12345 at 2020-03-08 12:07:29
outmol 文件里找到了这些参数，想请教一下是什么意思？
Tungsten     nbas=  5, z=  74, nrfn=  7, rcut=  8.50, e_ref= -0.096192 Ha
  DSPP: PWC_PBE s 01d21 release   rcore=  1.48  zval=  14.00  74.00...

nbas指的是基函数类型的编号，z指的是核电荷，nrfn指的是径向函数的数目（但不一定是最终的基函数数目，有些根据基组定义会被去掉），rcut是截断半径（Bohr单位），e_ref是你采用的截断半径和基组计算原子相对于原子在当前理论精度下“精确”的能量之差。
后面的DSPP: PWC_PBE 01d21是赝势的信息，rcore指的是赝势的芯半径，zval后面两个数指的是价电子数目和全电子的核电荷数。
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ck12345
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4楼2020-03-08 12:49:25
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ck12345

新虫 (初入文坛)
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4楼: Originally posted by 卡开发发 at 2020-03-08 12:49:25
nbas指的是基函数类型的编号，z指的是核电荷，nrfn指的是径向函数的数目（但不一定是最终的基函数数目，有些根据基组定义会被去掉），rcut是截断半径（Bohr单位），e_ref是你采用的截断半径和基组计算原子相对于原 ...

意思就是除了14个电子外，其他的都被做为芯电子处理了是吗？查了W的电子排布式是[Xe]6s2  4f14  5d4 ，那么这个14是从哪来呢？文献里对Pt的描述是：DSPP; density functional semicore pseudopotential DSPP replaces the effects of core electrons (inner than the 4f orbital for Pt) with a simple potential, and includes some degree of relativistic correction)。对于W原子应该怎么描述呢
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5楼2020-03-12 15:12:43
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卡开发发

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5楼: Originally posted by ck12345 at 2020-03-12 15:12:43
意思就是除了14个电子外，其他的都被做为芯电子处理了是吗？查了W的电子排布式是6s2  4f14  5d4 ，那么这个14是从哪来呢？文献里对Pt的描述是：DSPP; density functional semicore pseudopotential DSPP replaces  ...

看后面的occ的信息
   n=5  L=0  occ= 2.00 e=      -2.897551Ha       -78.8464eV
   n=5  L=1  occ= 6.00 e=      -1.572247Ha       -42.7830eV
   n=5  L=2  occ= 4.00 e=      -0.147830Ha        -4.0227eV
   n=6  L=0  occ= 2.00 e=      -0.194117Ha        -5.2822eV
   n=5  L=2  occ= 0.00 e=      -0.729681Ha       -19.8556eV
   n=6  L=0  occ= 0.00 e=      -0.707365Ha       -19.2484eV
   n=6  L=1  occ= 0.00 e=      -0.470567Ha       -12.8048eV
occ不为0的表示占据态，其中5s2 5p6 5d4 6s2，这些被认为是价层的组态。
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6楼2020-03-12 15:59:54
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huaxuexi111

金虫 (小有名气)
婆婆6nron wohepeies0

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7楼2020-03-22 11:18:08
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