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spring965

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】[求助]氢键质子给体 X-H极化程度如何判断

氢键形成前后,质子给体X-H的极化程度增强
pol(X) inσ(X—H) (%)
这个极化程度如何判断?
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zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
spring965(金币+2,VIP+0):O(∩_∩)O谢谢,这个得好好研究,我的QQ:386065123,希望可以向你请教 7-1 12:38
yuhuobuku(金币+3,VIP+0):谢谢交流 7-2 17:25
spring965(金币+3,VIP+0): 9-7 07:54

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1275706&fpage=1&view=&highlight=&page=2
的氢键Δρ图可否判断?

这个氢键Δρ图给出了形成氢键前后的电子净变化,体现了极性形成的情形和原因。

[ Last edited by zhou2009 on 2009-7-1 at 09:03 ]
2楼2009-07-01 08:59:51
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zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
spring965(金币+2,VIP+0):谢谢 9-8 08:29
见到你又给我加分,你很关注这个问题,有来无往非礼也,忙又给你回一帖。

关于氢键质子给体 X-H极化程度如何判断,我觉得还可以直接从GS计算的电子集居数来推算。

通常,由于这种电子集居数的计算时均分了重叠密度,对不同体积的原子完全不可比较、不可采用。
但是对于氢键质子给体 X-H来说,比较氢键形成前后的 X-H,它的系统误差可以抵消,还是可以用来定量说明问题的。

这时,可以在密度矩阵中分别找到氢键形成前后给体X-H的X和H的电子集居数,计算它们的变化,就应能得到极化程度的变化。

当然,在密度矩阵中电子集居数是以基组分配的,对一个原子来说,除了将基组分配的集居数相加外,它还有很多的信息。
如用6-311++G**算的二聚水氢键,给体X-H的H的电子集居数,氢键前集居数为1s 0.27039、2s 0.38426;氢键后集居数为1s 0.44432、2s 0.07500
这一方面表明氢键后H的电子集居数减少了, X-H极化程度加强了,另一方面表明H的电子向内层收缩了,失了电子当然会收缩。

还有一个问题,氢键形成时是会有少量孤对电子从给体流向质子给体 X-H的,它也会叠加在X-H上,也构成X-H极化,也是极化的内容,甚至是X-H极化加强的原因。

孤对电子从给体流向质子给体 X-H的量,不能从给体X-H的X和H的电子集居数中分离出来,只能从孤对电子那里核算出来,孤对电子原来应为2,现在少了,这少的量就是流向质子给体 X-H的量。其它因为轨道对称性不同、正交,不会发生电子流动。

经验、传统的氢键,把电子的转移理解为流向质子给体H,但量化计算并不支持这种猜想,因为氢键中质子给体H的电子反而减少了,X-H的极化程度增大了。氢键远比直观想象要复杂得多!

我试算了二聚水的氢键,并试用量化图形去解说它,此帖正在拟稿中,或可将草稿传给你参考。

又:此帖“从量子化学图形解读二聚水氢键”草稿已发给你,望多提意见。

[ Last edited by zhou2009 on 2009-9-10 at 16:17 ]
3楼2009-09-07 09:48:45
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piaoma

木虫 (小有名气)

NBO可以的


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
NBO可以的,输出文件有这一项;
我猜想通过计算成键的偶极矩或许也能说明问题
以上可在NBO网站
4楼2009-09-07 16:01:18
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