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xiaocaiyuan

木虫 (小有名气)

[交流] 关于建系统发育树的一些问题

我在建系统发育树的时候,遇到一件很奇怪的事。
就是即使在NCBI上比对出来是99%相似的两个核酸序列,在系统发育树上就是离得很远。
请教各位高手,该怎么解决这个问题?
我用的是MEGA软件,NJ法。
谢谢!
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weilin2378

木虫 (小有名气)

可能是你建树序列的长度不一致。要用相同长度的序列建树
5楼2009-07-03 11:17:27
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xiaocaiyuan

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 棋宴 at 2009-7-1 21:47:
可能是方向反了

什么意思?能不能讲的仔细一点啊?谢谢!
4楼2009-07-03 11:12:30
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tsingtao2008

木虫 (著名写手)

地球村村民


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
建树最好的软件是paup*

1 注意都要用Sense strand序列;
2 一般要求比对后修剪整齐
钱要流动,人要走动
6楼2009-07-03 14:02:27
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