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xiaocaiyuan

木虫 (小有名气)

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专业: 环境工程

[交流] 关于建系统发育树的一些问题

我在建系统发育树的时候，遇到一件很奇怪的事。
就是即使在NCBI上比对出来是99%相似的两个核酸序列，在系统发育树上就是离得很远。
请教各位高手，该怎么解决这个问题？
我用的是MEGA软件，NJ法。
谢谢！

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1楼 2009-06-30 21:57:25

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xiaocaiyuan

木虫 (小有名气)

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没人知道吗？

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2楼2009-07-01 16:52:29

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棋宴

新虫 (初入文坛)

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虫号: 627107
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专业: 环境微生物学

可能是方向反了

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3楼2009-07-01 21:47:39

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xiaocaiyuan

木虫 (小有名气)

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引用回帖:

Originally posted by 棋宴 at 2009-7-1 21:47:
可能是方向反了

什么意思？能不能讲的仔细一点啊？谢谢！

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4楼2009-07-03 11:12:30

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weilin2378

木虫 (小有名气)

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可能是你建树序列的长度不一致。要用相同长度的序列建树

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5楼2009-07-03 11:17:27

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tsingtao2008

木虫 (著名写手)

地球村村民

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性别: GG
专业: 植物遗传学

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

建树最好的软件是paup*

1 注意都要用Sense strand序列；
2 一般要求比对后修剪整齐

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钱要流动，人要走动

6楼2009-07-03 14:02:27

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