24小时热门版块排行榜    

查看: 1784  |  回复: 12
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

hongsemenghuan

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】RMD和ReaxFF动力学是一种方法吗?有什么区别?

我是刚接触到分子反应动力学,在文献上看到这两种分子动力学方法,是用来模拟化学反应动力学过程的。RMD(reactive molecular dynamics)反应性分子动力学和以ReaxFF(reactive force field)为基础的分子动力学方法是一回事吗?他们有什么区别啊?谢谢指教!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:19 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hongsemenghuan

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by lei0736 at 2009-7-2 21:20:
有现成的 而且估计比你自己编的功能强大
如果你很强很强 另当别论
期待你的MATLAB版的MD出炉

啊?我刚刚接触分子动力学,那怎么办啊?我想要做经典的以ReaxFF为基础的分子动力学模拟化学反应过程,那应该用楼上(lammps,dl-poly,moldy)的哪个软件比较好啊?我在文献上看到说用Fortran算的,我想fortran和matlab应该差不多吧,请指教,谢谢!
9楼2009-07-02 21:31:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

qphll

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):3q! 6-30 14:20
hongsemenghuan(金币+3,VIP+0):谢谢指教 7-1 09:22
RMD是MD中的一种,其之所以能模拟reactive过程,主要是由于reactive force field的存在,而这种反应性力场中,ReaxFF是一个代表.

所以,一个是方法,一个是力场,互相依赖.
Life, Love, Laugh.
2楼2009-06-30 14:05:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hongsemenghuan

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by qphll at 2009-6-30 14:05:
RMD是MD中的一种,其之所以能模拟reactive过程,主要是由于reactive force field的存在,而这种反应性力场中,ReaxFF是一个代表.

所以,一个是方法,一个是力场,互相依赖.

说得很明白,那密度泛函分子动力学和他们之间又是什么关系呢?希望能指点一下,谢谢了!
3楼2009-07-01 09:21:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hongsemenghuan(金币+2,VIP+0):谢谢,同时期待您更多的指教,呵呵 7-1 11:04
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 05年注册的新虫 稀罕啊 7-1 11:07
hongsemenghuan(金币+3,VIP+0):thankyou 7-2 07:26
密度泛函动力学?

如果以CPMD软件来作为比方(其实CPMD应该也算是一种方法,只是后来慢慢完善和扩展了,也成了软件包), 那么CPMD中的MD部分和Lammps以ReaxFF为力场的MD显然是不一样的.前者可以说是基于第一性原理的,只需要知道原子种类(实际上知道原子核和电子排布)和原子的坐标,那么一切性质都可以严格计算而来, 计算是在电子这个层次的,这也就决定了它的计算规模(时间尺度和空间尺度); 而后者是基于原子的计算, 只是和一般的classic MD相比, 由于ReaxFF力场可以预测键的生成和断裂,具有了'预测'反应的特性,所以这个基础上的MD是可以比classic MD看到等多的性质, 模拟的体系(以lammps为例)也是可以达到数千数万原子级别,当然,由于ReaxFF需要计算bond order,所以略微在速度上拖了一些后腿,但是和CPMD那不是一个级别的,我是说速度和规模.

不知道有没有部分说明啦?

希望更多人发表意见.
Life, Love, Laugh.
4楼2009-07-01 09:53:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:40 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:23 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 7/350 2026-11-11 04:21 by Z7qfCsdIiD1T
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:01 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 03:56 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:32 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 5/250 2026-11-11 00:59 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 4/200 2026-11-10 22:39 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 4/200 2026-11-10 20:51 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-10 20:12 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 申请环境,微生物方向博士 +3 浅笑09 2026-11-08 3/150 2026-11-10 12:44 by 可淡不可忘
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 4/200 2026-11-10 01:29 by FChKX8meu1ds
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 12/600 2026-11-09 13:26 by Equinoxhua
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
请填处理意见