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【求助】设置周期性边界条件
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我将Si沿001方向切，形成如图所示的图形。我现在想让这个结构在X和Y方向上有周期性，Z方向上无限延长。 看之前版上有讨论这个问题，是建立一个超晶胞。那么我都已经切成这样了，如何再建立超晶胞呢？ |
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5楼2009-06-30 16:14:56
yxcai
铁杆木虫 (著名写手)
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2楼2009-06-30 10:48:09
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- 专业: 碳素材料与超硬材料
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freshgirl(金币+1,VIP+0):谢谢参与 6-30 16:15
freshgirl(金币+1,VIP+0):谢谢参与 6-30 16:15
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在建模时候不需要考虑z方向,比如你的XY方向建立好了,size为:10.0*12.0 以长方体盒子为例子,用vmd打开,在控制台输入如下命令: molinfo top set a 10.0 molinfo tio set b 12.o molinfo top set c 15.0 molinfo top set alpha 90.0 molinfo top set beta 90.0 molinfo top set gamma 90.0 然后在representation里面检查周期性盒子是否完美. 这里c设置的15.0,数值只要保证该结构不会和它的镜像作用就可以.当然取得太大,也是浪费,可以通过优化找个这个值 如果楼主有用MS,那么我记得MS的tutorial里面有这个部分的建模,真空层的设置其实就是设置一个合适的slab高度. |
4楼2009-06-30 14:46:01