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shike

铜虫 (初入文坛)

[交流] 免疫共沉淀能不能用来找未知蛋白

请问各位高手,免疫共沉淀能不能用来找未知蛋白?如果可以用,用什么方法来验证是否是假阳性?
和酵母双杂交相比,有何优缺点?
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匿名

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
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9楼2009-06-29 11:23:57
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yyn0452

木虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
个人觉得不行,因为免疫共沉淀以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。 其原理是:当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来。如果用蛋白质X的抗体免疫沉淀X,那么与X在体内结合的蛋白质Y也能沉淀下来。这种方法常用于测定两种目标蛋白质是否在体内结合;也可用于确定一种特定蛋白质的新的作用搭档。
未知蛋白,你不知道它的作用搭档,故无法实现
2楼2009-06-25 21:06:46
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shike

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by yyn0452 at 2009-6-25 21:06:
个人觉得不行,因为免疫共沉淀以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。 其原理是:当细胞在非变性条件下被裂解时,完整 ...

谢谢回帖,我的意思是用一个已知的蛋白来找相互作用的未知蛋白。
3楼2009-06-25 21:56:19
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aaaaaa1380

至尊木虫 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这与你用的抗体的特异性程度有关,特异性不强的,有很大强度的假阳性可能,特异性强的,假阳性程度就相对较低

强烈推荐你用不同的实验方法来验证:比如酵母双杂,或者用以知蛋白的不同抗体来试试能不能同样能抓到你要的新蛋白

祝实验顺利!!!
4楼2009-06-25 22:05:31
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