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【求助】生物信息学——可变剪接预测
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不知有没有大虾，做过这方面的研究。我刚刚接触序列比对这块，很多不懂，想请教一下关于数据收集的问题。 我下载过人基因组FASTA数据，但是发现下载的genome的数据好像没有标注剪接位点边界。我如果用cDNA或者EST跟genome比较，怎么能够知道这个剪接型是不是新的？ 用EST/cDNA比对基因组时，想查找一个基因的可变剪接型，是不是需要事先收集这个基因相对应的cDNA或者EST。还是用基因组所有EST或cDNA跟这个基因比对？ 谢谢！ |
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