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通过序列比对寻找新的剪接型
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这是属于生物信息学的，我也不知道发在这里合适不？ 我是最近开始接触序列比对这一方面。有些不明白，看到论坛里有过这类似的序列比对的帖子，所以想请教一些关于可变剪接理论预测的问题。 1.我下载过人的染色体FASTA数据，里面全部都是碱基序列，并没有标注内含子外显子位置。如果用EST和没有标注剪接位点边界的基因组序列比对，怎么知道发生了哪种可变剪接？ 2.我现在在看文章的时候，很多都提到下载全长 cDNA 克隆序列的完整注释。这个注释有什么用处？ 3.有文章提到在寻找新的剪接型时，要收集一个基因组对应的表达序列（EST或全长cDNA）。但是我在NCBI中查找：要么是一个物种的全部EST或cDNA；要么就只有通过ENTRZ检索，这样检索只有一条一条的去下载，有的染色体有上万条，无法这样逐条手工下载。不知怎样能够方便地收集一个染色体对应的表达序列 |
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2楼2009-06-23 20:14:45
