| 查看: 154 | 回复: 1 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
通过序列比对寻找新的剪接型
|
|||
|
这是属于生物信息学的，我也不知道发在这里合适不？ 我是最近开始接触序列比对这一方面。有些不明白，看到论坛里有过这类似的序列比对的帖子，所以想请教一些关于可变剪接理论预测的问题。 1.我下载过人的染色体FASTA数据，里面全部都是碱基序列，并没有标注内含子外显子位置。如果用EST和没有标注剪接位点边界的基因组序列比对，怎么知道发生了哪种可变剪接？ 2.我现在在看文章的时候，很多都提到下载全长 cDNA 克隆序列的完整注释。这个注释有什么用处？ 3.有文章提到在寻找新的剪接型时，要收集一个基因组对应的表达序列（EST或全长cDNA）。但是我在NCBI中查找：要么是一个物种的全部EST或cDNA；要么就只有通过ENTRZ检索，这样检索只有一条一条的去下载，有的染色体有上万条，无法这样逐条手工下载。不知怎样能够方便地收集一个染色体对应的表达序列 |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有4人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有5人回复
2楼2009-06-23 20:14:45
