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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】【求助】forcite计算的msd，选择 set后，扩散系数是Dx，还是别的？
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zyj8119

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】【求助】forcite计算的msd，选择 set后，扩散系数是Dx，还是别的？

rt，用forcite跑了800ps的MD,在轨迹文件中选择了被吸附的气体分子，吸附了2种，然后edit set，然后在forcite中analysis中，选择这种气体msd，前100ps不要，得到的msd在excel中，通过添加趋势线，扩散系数到底是哪个方向的？谢谢！！！
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好好学习，天天向上。
1楼 2009-06-23 14:39:31
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★
ice_rain(金币+1):xiexie~ 2010-03-15 21:57
引用回帖:
Originally posted by fu19871111 at 2010-03-14 10:41:03:

成直线，是完全直线还是近视直线就行？

应该是近似了，我是用EXCEL看的。
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好好学习，天天向上。
9楼2010-03-14 22:25:02
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zyj8119

木虫 (著名写手)
谢谢！呵呵，高清楚了。。
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好好学习，天天向上。
4楼2009-06-25 10:19:30
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guosy1999

木虫 (正式写手)

中纪委反2协会督导员
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2009-6-23 14:39:
rt，用forcite跑了800ps的MD,在轨迹文件中选择了被吸附的气体分子，吸附了2种，然后edit set，然后在forcite中analysis中，选择这种气体msd，前100ps不要，得到的msd在excel中，通过添加趋势线，扩散系数到底是哪 ...

不知道Forcite里的动力学做扩散和Discover里的动力学有什么区别？！
如果扩散的分子较多，如何选中所有同类分子呢？
你是怎样判断动力学达平衡的呢？谢谢。
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少年不识愁滋味，为赋新词强说愁。
5楼2009-07-07 15:02:53
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★
freshgirl(金币+1,VIP+0):谢谢~ 7-11 00:02
这个，只要最后的logMSD和logt的曲线成直线，就平衡了。
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好好学习，天天向上。
6楼2009-07-10 14:04:25
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