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zyj8119

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】【求助】forcite计算的msd,选择 set后,扩散系数是Dx,还是别的?

rt,用forcite跑了800ps的MD,在轨迹文件中选择了被吸附的气体分子,吸附了2种,然后edit set,然后在forcite中analysis中,选择这种气体msd,前100ps不要,得到的msd在excel中,通过添加趋势线,扩散系数到底是哪个方向的?谢谢!!!
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好好学习,天天向上。
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zyj8119

木虫 (著名写手)

谢谢!呵呵,高清楚了。。
好好学习,天天向上。
4楼2009-06-25 10:19:30
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guosy1999

木虫 (正式写手)

中纪委反2协会督导员


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2009-6-23 14:39:
rt,用forcite跑了800ps的MD,在轨迹文件中选择了被吸附的气体分子,吸附了2种,然后edit set,然后在forcite中analysis中,选择这种气体msd,前100ps不要,得到的msd在excel中,通过添加趋势线,扩散系数到底是哪 ...

不知道Forcite里的动力学做扩散和Discover里的动力学有什么区别?!
如果扩散的分子较多,如何选中所有同类分子呢?
你是怎样判断动力学达平衡的呢?谢谢。
少年不识愁滋味,为赋新词强说愁。
5楼2009-07-07 15:02:53
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zyj8119

木虫 (著名写手)


freshgirl(金币+1,VIP+0):谢谢~ 7-11 00:02
这个,只要最后的logMSD和logt的曲线成直线,就平衡了。
好好学习,天天向上。
6楼2009-07-10 14:04:25
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fu19871111

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
成直线,是完全直线还是近视直线就行?
7楼2010-03-14 10:40:44
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