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【求助】关于如何调整高斯优化结果中的分子坐标问题
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请大家帮忙或者讨论下，如何才能有效调整高斯输出文件中的坐标， 或者能不能在开始优化时就硬性地规定坐标取向，因为坐标问题涉及到最后的分子轨道分析，所以对分析有些问题还是很重要的。 如果要调整坐标，是不是也要考虑分子轨道的特性等方面的问题，希望大家不吝赐教，谢谢！ 可能是我的表达有问题，我想问的是：如何才能让z轴垂直于分子平面，而xy轴与分子平面共面，有些时候在GaussianView当中画出的分子构型以及在Gaussian输出文件中的分子构型是y或z轴垂直于分子平面，而z轴却在分子平面内。1.如何调整坐标可以使z轴垂直于分子平面，2.如果调整不了坐标，在分析轨道成份时如何转换如配合物中的过渡金属原子中的dz轨道使其与分子平面垂直，不知道我说清楚了吗，不太会表达啊，多谢大家了 [ Last edited by Ado on 2009-6-29 at 08:53 ] |
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