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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】关于如何调整高斯优化结果中的分子坐标问题
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Ado

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于如何调整高斯优化结果中的分子坐标问题

请大家帮忙或者讨论下，如何才能有效调整高斯输出文件中的坐标，
或者能不能在开始优化时就硬性地规定坐标取向，因为坐标问题涉及到最后的分子轨道分析，所以对分析有些问题还是很重要的。
如果要调整坐标，是不是也要考虑分子轨道的特性等方面的问题，希望大家不吝赐教，谢谢！

可能是我的表达有问题，我想问的是：如何才能让z轴垂直于分子平面，而xy轴与分子平面共面，有些时候在GaussianView当中画出的分子构型以及在Gaussian输出文件中的分子构型是y或z轴垂直于分子平面，而z轴却在分子平面内。1.如何调整坐标可以使z轴垂直于分子平面，2.如果调整不了坐标，在分析轨道成份时如何转换如配合物中的过渡金属原子中的dz轨道使其与分子平面垂直，不知道我说清楚了吗，不太会表达啊，多谢大家了

[ Last edited by Ado on 2009-6-29 at 08:53 ]
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1楼 2009-06-23 08:43:27
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-24 21:50
我也没看懂
LZ是不是这个意思：坐标的取向不同，分子轨道的符号发就会不同？如果是这样，那你分析轨道的时候，把它的分子轨道的符号调整成你想要的坐标中的符号，就是了呗

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-6-24 at 18:52 ]
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3楼2009-06-24 18:50:53
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