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yunfan951铁杆木虫 (著名写手)
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[交流]
【求助】【求助】vasp：如何能将下面脚本编译用于并行就算
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请教大家一个问题：对于下面的脚本文件如何进行并行计算，我们用的是中科院超级计算机？ 脚本文件如下： #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 3.80 3.85 3.90 3.95 4.00 4.05 4.10 4.15 4.20 4.25 4.30 do cat > POSCAR < Al-fcc $i 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 1 Direct 0.0 0.0 0.0 ! echo "a = $i angstrom " vasp-s E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "12.6f \n", $5 }'` V=`grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "12.4f \n", $5 }'` echo $V $E >>EtVo.dat echo $i $E >>SUMMARY.a done 谢谢啦! |
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tjyl
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你的意思是不是想修改一个这脚本使之能充分利用你们租用的节点或者是说任务提交脚本里定义的使用节点、CPU数？ 脚本开头当然是按照任务调度系统的要求写啊。中科院的那个我们以前用过，后来都是用的上海超算的了。 把 vasp-s 改成 mpirun -np XX(脚本里定义的CPU数) vasp 1>out1_$i 2>errorlog & echo "a = $i angstrom " 这个去掉吧，或者直接重定向到一个文件 [ Last edited by tjyl on 2009-7-12 at 12:19 ] |
3楼2009-07-12 12:14:50
nkleof
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yunfan951
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5楼2009-10-22 17:54:24