| 查看: 301 | 回复: 4 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
yunfan951铁杆木虫 (著名写手)
|
[交流]
【求助】【求助】vasp：如何能将下面脚本编译用于并行就算
|
||
|
请教大家一个问题：对于下面的脚本文件如何进行并行计算，我们用的是中科院超级计算机？ 脚本文件如下： #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 3.80 3.85 3.90 3.95 4.00 4.05 4.10 4.15 4.20 4.25 4.30 do cat > POSCAR < Al-fcc $i 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 1 Direct 0.0 0.0 0.0 ! echo "a = $i angstrom " vasp-s E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "12.6f \n", $5 }'` V=`grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "12.4f \n", $5 }'` echo $V $E >>EtVo.dat echo $i $E >>SUMMARY.a done 谢谢啦! |
回复此楼» 猜你喜欢
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有4人回复
-
真诚求助：手里的省社科项目结项要求主持人一篇中文核心，有什么渠道能发核心吗
已经有6人回复
-
孩子确诊有中度注意力缺陷
已经有14人回复
-
三甲基碘化亚砜的氧化反应
已经有4人回复
-
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢
已经有5人回复
-
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗
已经有5人回复
-
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有3人回复
-
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有4人回复
-
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
-
AI论文写作工具：是科研加速器还是学术作弊器？
已经有3人回复
zhangkun7581
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 156.5
- 散金: 698
- 红花: 17
- 帖子: 302
- 在线: 287.2小时
- 虫号: 705678
- 注册: 2009-02-21
- 专业: 胶体与界面化学
2楼2009-07-12 10:48:06
tjyl
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3218.1
- 红花: 2
- 帖子: 576
- 在线: 156.6小时
- 虫号: 765184
- 注册: 2009-05-07
- 专业: 生物无机化学
- 管辖: 程序语言
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
fegg7502(金币+3,VIP+0):thank you very much! 7-13 03:33
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
fegg7502(金币+3,VIP+0):thank you very much! 7-13 03:33
|
你的意思是不是想修改一个这脚本使之能充分利用你们租用的节点或者是说任务提交脚本里定义的使用节点、CPU数？ 脚本开头当然是按照任务调度系统的要求写啊。中科院的那个我们以前用过，后来都是用的上海超算的了。 把 vasp-s 改成 mpirun -np XX(脚本里定义的CPU数) vasp 1>out1_$i 2>errorlog & echo "a = $i angstrom " 这个去掉吧，或者直接重定向到一个文件 [ Last edited by tjyl on 2009-7-12 at 12:19 ] |
3楼2009-07-12 12:14:50
nkleof
银虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2093.2
- 散金: 649
- 红花: 5
- 帖子: 813
- 在线: 165.9小时
- 虫号: 152581
- 注册: 2006-01-02
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
4楼2009-07-14 22:17:58
yunfan951
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 6404.5
- 红花: 1
- 帖子: 1625
- 在线: 214.5小时
- 虫号: 499483
- 注册: 2008-02-11
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
5楼2009-10-22 17:54:24