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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zhuzhifeng

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】TwoProbe Calculation 的奇怪问题(5个金币求助)

建立了自旋极化(选取initial_scaled_spin)的两电极系统,在Electrodes Calculation 和 Equivalent Bulk Calculation (Initial Density for TwoProbe)计算都通过,但到了TwoProbe Calculation,每次都在
# Mulliken Population for sc 1
的地方报错,说矩阵不能对角化

Traceback (most recent call last):
  File "c:/docume~1/zhuzhi~1/locals~1/temp/2/tmpfyohy6.nl", line 311, in ?
    runtime_parameters = runtime_parameters
ATKError: inverse(DZMatrix const & : Could not LU factorize!
Terminated Abnormally

看计算过程,TwoProbe Calculation计算的是散射区电极和中心分子,发现# Mulliken Population for sc 1 内电荷基本都是q=0(比如q=-0.00001),但在# Mulliken Population for sc 0的q是正常的。也修改过一些参数,也优化过两电极系统结构,每次都是这样的错误,已经在这个问题上迷茫了很久,请达人给以指点,十分感谢!
另外说明:如果去掉自旋,计算能够通过。
不知道大家有没有遇到同样的问题,也可以讨论一下。
金币不多,仅表心意,给最佳答复者5个金币
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛

请回答以下几个问题:你表面和电极分别设置了多少层?优化的的结构是否收敛?都尝试修改过什么参数? 你用的基失是什么基失?
2楼2009-06-21 23:32:52
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zhuzhifeng

木虫 (小有名气)


yjr(金币+1,VIP+0):难得这么积极,鼓励一下 6-22 16:05
引用回帖:
Originally posted by zdhlover at 2009-6-21 23:32:
请回答以下几个问题:你表面和电极分别设置了多少层?优化的的结构是否收敛?都尝试修改过什么参数? 你用的基失是什么基失?

我是一个初学者,如有描述不当之处还请指出。
1。表面的电极分别为左3层、右4层,沿FCC结构的(001)方向;
2。中心分子结构用过老版的CG优化和新版的拟牛顿法优化,计算收敛且优化结果基本相同;对中心分子和散射电极的间距用计算能量最低的原则取其间距值;
3。尝试修改iterationMixingParameters中的algorithm, diagonal_mixing_parameter, quantity;
4。基矢采用SZP和DZP都在TwoProbe Calculation出现一样的错误,交换关联能尝试过GGA.PBE和GGA.RevPBE,都是和上面一样的错误。

不知道什么地方出了问题,谢谢
3楼2009-06-22 15:11:33
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yjr(金币+1,VIP+0):给给奖励 6-22 16:04
zhuzhifeng(金币+5,VIP+0):谢谢,我试一下 6-23 10:25
spur(金币+2,VIP+0): 3Q!!谢谢帮助!^_^ 6-23 21:01
一般情况有如下情况:1,你的电极结构不合理,请尝试沿Z方向增加电极原胞数目
                              2,尝试减小Z方向k点数目
                              3,检查内存是否够用,体系是否过大
                              4,修改equivalent bulk calculation 为neutral atomic density
          希望能解决你的问题
4楼2009-06-22 15:47:05
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zhuzhifeng

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zdhlover at 2009-6-22 15:47:
一般情况有如下情况:1,你的电极结构不合理,请尝试沿Z方向增加电极原胞数目
                              2,尝试减小Z方向k点数目
                              3,检查内存是否够用,体系是否过大
    ...

我试试方法4,因为我的bulk是自己建立的一个比电极大的bulk。才100个左右的原子,4G内存+缓存没有出现内存和缓存警报。
谢谢你的回复
5楼2009-06-23 10:38:24
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