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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】高斯优化后发生键的断裂，请问怎么解决？
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★
erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 6-22 13:17
xuxiao119(金币+1,VIP+0):谢谢 6-22 14:45
引用回帖:
Originally posted by tiechong at 2009-6-21 00:38:
QUOTE: 我就用“断键的gjf文件”进行G03计算，发现不能正常计算下去。

最好用gauss view 提交文件给高斯运算, 我感觉CHEM3D保存输入文件的时候有时会把格式搞乱,让计算软件无法识别.或者你检查一下输入文件,手 ...

不能正常计算，有很多种可能性，键的形式是很难引起计算失败的。
如果真的认为是“断键”造成计算失败，那建议你删掉geom=connectivity 以及对应的原子链接说明部分
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11楼2009-06-22 09:30:49
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S07111072

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 6-22 13:17
xuxiao119(金币+1,VIP+0):谢谢 6-22 14:45
引用回帖:
Originally posted by xuxiao119 at 2009-6-20 16:09:
jgf文件再用3D打开后，在保存之后就不是jgf文件了，G03运行不了啊

G03运行的文件是gjf文件不是jgf文件，键是否连接在不同的软件中显示是不同的，因为它们的参数范围是可以设置的，如果你给定的参数在所用软件的参数范围内那么就可以看到成键
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12楼2009-06-22 11:21:13
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dgcrcat

金虫 (小有名气)
★
xuxiao119(金币+1,VIP+0):谢谢 6-23 18:22
是不是结构最稳定的时候这些原子间不适合形成化学键了
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13楼2009-06-22 16:35:25
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★ ★ ★
yuhuobuku(金币+3,VIP+0):谢谢交流 6-24 21:49
xuxiao119(金币+1,VIP+0):谢谢你的回复，很有启发性 6-27 15:36
引用回帖:
Originally posted by dgcrcat at 2009-6-22 16:35:
是不是结构最稳定的时候这些原子间不适合形成化学键了

我实在忍不住，想多说一句了：
什么叫化学键？化学键（chemical bond）是指分子或晶体内相邻原子（或离子）间强烈的相互作用。只要两个原子之间有强烈的相互作用，那么他们之间就有化学键。并不是某个图像化分子3D软件，在两个原子之间显示了一根“棍儿”，那么他们之间就有化学键，没显示“棍儿”，他们之间就没有化学键。

化学键就是个形式。本质问题是两个原子的种类以及它们之间的相对位置。
不恰当地“注重”形式上的化学键，是刚刚从实验化学转到量子化学的人的通病
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14楼2009-06-24 18:47:24
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shijing467

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
（1）对于量子化学来说，单键双键三键共轭键等各种键型没有任何意义。有意义的是原子的类型及其相互间的空间位置。我知道这对刚刚接触量化的人来说，接受起来很不爽。但是进了这个门就要守规矩。
（2）你看看你的“断掉的键”两端的原子，这两个原子的距离还合适吗》只要还合适，就是对的

我的问题是：什么样的距离使两个原子的距离合适？
谢谢指教！
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只有学会做人了 才能做好每件事
15楼2011-08-16 10:08:48
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