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xuxiao119

铁虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】高斯优化后发生键的断裂，请问怎么解决？

我想计算的分子是一个离子化合物，其中阳离子部分是二个四丁基胺正离子，而阴离子部分是带+2价的一个多酸离子，含有Mo原子。

我用CHEM 3D打开后，想用MOPAC进行预优化一下，但是总是显示Parameters for some elements missing.

之后我就直接在3D中的Gaussian直接创建高斯的gjf文件，但重新在3D打开后，发现键断裂了，我用的是B3LYP，基准是6-31G或LANL2DZ,我以前没有算过带有金属因素，而且是还有阴阳离子的结构，不知道一些参数是怎么设置的，还有这种键断了怎么解决？想请教一下各位大虾！
我的CIF文件：

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1楼2009-06-19 21:47:21

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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

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yuhuobuku(金币+3,VIP+0):谢谢交流 6-24 21:49
xuxiao119(金币+1,VIP+0):谢谢你的回复，很有启发性 6-27 15:36

引用回帖:

Originally posted by dgcrcat at 2009-6-22 16:35:

是不是结构最稳定的时候这些原子间不适合形成化学键了

我实在忍不住，想多说一句了：
什么叫化学键？化学键（chemical bond）是指分子或晶体内相邻原子（或离子）间强烈的相互作用。只要两个原子之间有强烈的相互作用，那么他们之间就有化学键。并不是某个图像化分子3D软件，在两个原子之间显示了一根“棍儿”，那么他们之间就有化学键，没显示“棍儿”，他们之间就没有化学键。

化学键就是个形式。本质问题是两个原子的种类以及它们之间的相对位置。
不恰当地“注重”形式上的化学键，是刚刚从实验化学转到量子化学的人的通病