24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
查看: 3078  |  回复: 13
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xuxiao119

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】高斯优化后发生键的断裂,请问怎么解决?

我想计算的分子是一个离子化合物,其中阳离子部分是二个四丁基胺正离子,而阴离子部分是带+2价的一个多酸离子,含有Mo原子。

我用CHEM 3D打开后,想用MOPAC进行预优化一下,但是总是显示Parameters for some elements missing.

之后我就直接在3D中的Gaussian直接创建高斯的gjf文件,但重新在3D打开后,发现键断裂了,我用的是B3LYP,基准是6-31G或LANL2DZ,我以前没有算过带有金属因素,而且是还有阴阳离子的结构,不知道一些参数是怎么设置的,还有这种键断了怎么解决?想请教一下各位大虾!
我的CIF文件:
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 6-20 20:23
xuxiao119(金币+1,VIP+0):谢谢 6-20 20:52
引用回帖:
Originally posted by xuxiao119 at 2009-6-19 21:58:
优化后发生键断裂了,在左边的笼状结构中,中心原子是氧,与之相连的是6个Mo原子,但优化后,与之连接的键都端了,不知道怎么解决这个问题,望各位高手指点一下!谢谢

(1)对于量子化学来说,单键双键三键共轭键等各种键型没有任何意义。有意义的是原子的类型及其相互间的空间位置。我知道这对刚刚接触量化的人来说,接受起来很不爽。但是进了这个门就要守规矩。
(2)你看看你的“断掉的键”两端的原子,这两个原子的距离还合适吗》只要还合适,就是对的
7楼2009-06-20 19:15:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

xuxiao119

铁虫 (小有名气)

CIF文件用3D打开的图

CIF文件用3D打开的图
2楼2009-06-19 21:49:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuxiao119

铁虫 (小有名气)

去掉阳离子部分的图

我想算的主要是阴离子部分中的轨道,所以我想把阳离子去掉
3楼2009-06-19 21:52:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuxiao119

铁虫 (小有名气)

优化之后发生键的断裂

优化后发生键断裂了,在左边的笼状结构中,中心原子是氧,与之相连的是6个Mo原子,但优化后,与之连接的键都端了,不知道怎么解决这个问题,望各位高手指点一下!谢谢
4楼2009-06-19 21:58:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见