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xuxiao119

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】高斯优化后发生键的断裂,请问怎么解决?

我想计算的分子是一个离子化合物,其中阳离子部分是二个四丁基胺正离子,而阴离子部分是带+2价的一个多酸离子,含有Mo原子。

我用CHEM 3D打开后,想用MOPAC进行预优化一下,但是总是显示Parameters for some elements missing.

之后我就直接在3D中的Gaussian直接创建高斯的gjf文件,但重新在3D打开后,发现键断裂了,我用的是B3LYP,基准是6-31G或LANL2DZ,我以前没有算过带有金属因素,而且是还有阴阳离子的结构,不知道一些参数是怎么设置的,还有这种键断了怎么解决?想请教一下各位大虾!
我的CIF文件:
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xuxiao119

铁虫 (小有名气)

jgf文件再用3D打开后,在保存之后就不是jgf文件了,G03运行不了啊
6楼2009-06-20 16:09:12
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xuxiao119

铁虫 (小有名气)

CIF文件用3D打开的图

CIF文件用3D打开的图
2楼2009-06-19 21:49:42
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xuxiao119

铁虫 (小有名气)

去掉阳离子部分的图

我想算的主要是阴离子部分中的轨道,所以我想把阳离子去掉
3楼2009-06-19 21:52:21
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xuxiao119

铁虫 (小有名气)

优化之后发生键的断裂

优化后发生键断裂了,在左边的笼状结构中,中心原子是氧,与之相连的是6个Mo原子,但优化后,与之连接的键都端了,不知道怎么解决这个问题,望各位高手指点一下!谢谢
4楼2009-06-19 21:58:45
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