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xuxiao119

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】高斯优化后发生键的断裂,请问怎么解决?

我想计算的分子是一个离子化合物,其中阳离子部分是二个四丁基胺正离子,而阴离子部分是带+2价的一个多酸离子,含有Mo原子。

我用CHEM 3D打开后,想用MOPAC进行预优化一下,但是总是显示Parameters for some elements missing.

之后我就直接在3D中的Gaussian直接创建高斯的gjf文件,但重新在3D打开后,发现键断裂了,我用的是B3LYP,基准是6-31G或LANL2DZ,我以前没有算过带有金属因素,而且是还有阴阳离子的结构,不知道一些参数是怎么设置的,还有这种键断了怎么解决?想请教一下各位大虾!
我的CIF文件:
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tiechong

金虫 (著名写手)

★ ★ ★
xuxiao119(金币+1,VIP+0):谢谢,你是说就这样直接带到G03里算就可以了吗? 6-20 13:14
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 6-20 15:59
化学计算只考虑空间位置,输出信息是不含键的,只是用CHEM3D打开加了键上去,我经常碰到,不理会
5楼2009-06-20 07:43:49
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tiechong

金虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):鼓励新人 6-21 08:24
xuxiao119(金币+1,VIP+0):谢谢 6-22 13:54
QUOTE: 我就用“断键的gjf文件”进行G03计算,发现不能正常计算下去。

最好用gauss view 提交文件给高斯运算, 我感觉CHEM3D保存输入文件的时候有时会把格式搞乱,让计算软件无法识别.或者你检查一下输入文件,手动修改一下
9楼2009-06-21 00:38:09
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