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huairpan木虫 (正式写手)
很牛
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[交流]
软件或者方法求助_预测基因的表达产物
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| 如题，现在手头上有一DNA序列，有什么软件或者方法可以预测出该序列所表达出的蛋白产物？多谢给出建议！ |
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
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你先用翻译软件找出阅读框，看一下是否完整的基因http://www.vivo.colostate.edu/molkit/translate/，使用该网址进行翻译，他会给出正向或反向三种阅读框，如果你的基因ATG前面有终止子，ATG后面若干长度处有终止子，而且从ATG到终止子的蛋白质序列去NCBI blast后与你的预期吻合，那么你得到极有可能是基因的全长，还可以去EST scan 一下，如果ESTscan的结果也支持，全长的可能性就极大了 MFold 预测二级结构 promoter scan预测启动子 core promoter预测转录起始 Expasy Protparam预测理化性质 signalp 3.0 分析信号肽 expasy TMHMM 预测跨膜区 Esypred3D预测三级结构， 类似软件和站点太多，你自己去搜吧 |
2楼2009-06-19 18:44:10
3楼2009-06-19 18:50:10
4楼2009-06-26 15:11:30