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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于NCBI的序列注册的问题【完结】
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zhaott

荣誉版主 (著名写手)

小虫爸

[交流] 关于NCBI的序列注册的问题【完结】

自己培养了一种菌，经16s rDNA鉴定后，发现最相近的同源性是98%，初步判断是一种新菌。
由于自己对这块不熟，请教有过相关经验的虫友，如何在NCBI上提交序列并注册，如能提供相关帮助，另有金币赠送。此贴只为抛砖引玉，能提供帮助的虫友并请短信联系。
已经提交了序列，收到回信如下
---------------------------------------------------------------------
We have received at gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov the following 1
sequence submissions from you:
                > bankit1235476 1 of a total of 1
Please provide the following information about your sequence submission:
[1] Are these sequences from:
  a) pure culture: or
  b) enrichment culture: , or
  c) bulk environmental DNA.
Send your response to:  gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov
For your reference, please find your preliminary flatfiles below
with the information we currently have.
Please reply using the original subject line.
This will allow for faster processing of your correspondence.
Sincerely,
----------------------------------------------------------------------------------
我分离的是纯菌，请问“find your preliminary flatfiles ”是不是要我提供相关的证据，不知具体指的是什么？
谢谢！

[ Last edited by zhaott on 2009-8-18 at 15:32 ]
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人生总有限功业总无涯
1楼 2009-06-19 01:55:18
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dyyyyy

铁杆木虫 (著名写手)
★
zhaott(金币+1,VIP+0):谢谢！申请过程中遇到的问题不知可否向你请教？ 6-19 23:56
有序列提交软件sequin，网上可以找到（我从NCBI上下载的），用它来提交。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2009-06-19 07:35:58
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dongjiqiao

铁杆木虫 (著名写手)
不知道，帮顶了~~·
赞一下 回复此楼
long,longlong.
3楼2009-06-19 08:53:43
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lifeip

至尊木虫 (知名作家)
★
zhaott(金币+1,VIP+0):谢谢！申请过程中遇到的问题不知可否向你请教？ 6-19 23:56
NCBI有专门的在线及离线软件用于提交基因或蛋白，如sequin即是一款离线软件，可以先在计算机上按说明进行操作，完成后即可通过mail提交。具体操作见使用说明，什么事情都有个开头，用过1、2次就会使用了。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2009-06-19 10:01:12
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ouqiaoming

木虫 (正式写手)
支持3楼的答案，

NCBI有专门的在线及离线软件用于提交基因或蛋白，如sequin即是一款离线软件，可以先在计算机上按说明进行操作，完成后即可通过mail提交。具体操作见使用说明，什么事情都有个开头，用过1、2次就会使用了。
赞一下 回复此楼
5楼2009-06-20 02:27:41
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zhaott

荣誉版主 (著名写手)

小虫爸
有了新问题，希望高手指教
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人生总有限功业总无涯
6楼2009-06-24 23:03:54
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zhaott

荣誉版主 (著名写手)
7楼2009-06-25 09:56:54
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hortihee

铜虫 (初入文坛)
★ ★ ★
zhaott(金币+3,VIP+0):日文翻译,多谢！ 8-18 10:37
日文翻译
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8楼2009-08-18 10:35:55
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傻子

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
http://www.liucheng.name/?p=816 这里有大致方法介绍，楼主看看先。

最近也在上传，摸索中。
赞一下(1人) 回复此楼
1984年中国制造,长173CM,净重64kg,采用人工智能，国家免检优质产品。
9楼2009-08-18 10:49:55
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