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【求助】消除震荡
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请教下大家 对消除震荡有什么心得没？做一个东西 优化一次 老是在震荡 4个标准 都是NO 势能面比较平缓 大家对于这样的体系 有什么办法解决没？ 对于势能面平缓的体系 怎么解决能加些什么命令 |
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yuhuobuku(金币+8,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:35
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在进行Gaussian计算时，经常会出现多个虚频个，每个都只有－30~－20左右，但是如果结构改动过大，则一不小心，虚频就会更大。消除虚频的主要方法是改变构型。其次在计算上还可以尝试：qc；nosymm；加大maxcyc；提高conver；iop(1/8=1)；gdiis；nolinear等。通常对于势能面很平，较小的虚频很难消除。 为了解决以上的这种现象,按如下的步骤一步步调整： 1）. 在优化时采用Scf(tight)的选项，增加收敛的标准。再去计算频率。如果还有虚频，参见下一步。 2）. 对称性的影响，很多情况下的虚频是由于分子本身的对称性造成的。这样，在优化时，如果必要，要将对称性降低，还有，输入文件有时是用内坐标。建议如果有虚频的话，将内坐标改成直角坐标优化。但是有时这一方法也并没有多大作用。 3）. 如果上述方法还有虚频，看一下虚频，找到强度较大的，将在频率中产生的原子的振动坐标加到相应的输入文件中。这样，重新计算。直到虚频没有。比较好的做法是分子结构输入用直角坐标，将这些产生虚频的振动坐标直接与原始坐标相加。加的时候不一定要将坐标直接相加，可以选择权重如1/3相加等。 4）. 实际上，如果分子柔性较大，很难找到最低点，这是电子结构计算的问题，这种情况下，需要动力学的 东西，用构象搜寻的办法解决。如：模拟退火，最陡下降法，淬火法等。将得到的能量最低的构象做一般的电子结构计算，这样，应当没有问题。 5）.如果上面几步仍然无法解决问题，则有可能是因为计算还没有得到最稳定的结构，那么或者是分子结构有问题，或者是计算错了，再者就是游离出现在计算的范畴。 [ Last edited by yjcmwgk on 2009-6-18 at 13:21 ] |
4楼2009-06-18 13:18:51
S07111072
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5楼2009-06-18 17:04:42
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