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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】消除震荡

请教下大家 对消除震荡有什么心得没?做一个东西 优化一次 老是在震荡 4个标准 都是NO   势能面比较平缓 大家对于这样的体系 有什么办法解决没?
   对于势能面平缓的体系 怎么解决能加些什么命令
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拒稿,终于体会到了!乱写接受,认真写拒稿,这就是2和4的区别吗?
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zlding

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:34
据说加gdiis命令可以消除震荡,你试一下
2楼2009-06-18 11:21:13
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gaochao85

铜虫 (正式写手)

★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:34
加 nolinear
3楼2009-06-18 11:37:53
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yuhuobuku(金币+8,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:35
在进行Gaussian计算时,经常会出现多个虚频个,每个都只有-30~-20左右,但是如果结构改动过大,则一不小心,虚频就会更大。消除虚频的主要方法是改变构型。其次在计算上还可以尝试:qc;nosymm;加大maxcyc;提高conver;iop(1/8=1);gdiis;nolinear等。通常对于势能面很平,较小的虚频很难消除。
为了解决以上的这种现象,按如下的步骤一步步调整:
1). 在优化时采用Scf(tight)的选项,增加收敛的标准。再去计算频率。如果还有虚频,参见下一步。
2). 对称性的影响,很多情况下的虚频是由于分子本身的对称性造成的。这样,在优化时,如果必要,要将对称性降低,还有,输入文件有时是用内坐标。建议如果有虚频的话,将内坐标改成直角坐标优化。但是有时这一方法也并没有多大作用。
3). 如果上述方法还有虚频,看一下虚频,找到强度较大的,将在频率中产生的原子的振动坐标加到相应的输入文件中。这样,重新计算。直到虚频没有。比较好的做法是分子结构输入用直角坐标,将这些产生虚频的振动坐标直接与原始坐标相加。加的时候不一定要将坐标直接相加,可以选择权重如1/3相加等。
4). 实际上,如果分子柔性较大,很难找到最低点,这是电子结构计算的问题,这种情况下,需要动力学的 东西,用构象搜寻的办法解决。如:模拟退火,最陡下降法,淬火法等。将得到的能量最低的构象做一般的电子结构计算,这样,应当没有问题。
5).如果上面几步仍然无法解决问题,则有可能是因为计算还没有得到最稳定的结构,那么或者是分子结构有问题,或者是计算错了,再者就是游离出现在计算的范畴。

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-6-18 at 13:21 ]
4楼2009-06-18 13:18:51
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S07111072

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):在进行Gaussian计算时,经常会出现多个虚频个,每个都只有-30~-20左右,但是如果结构改动过大,则一不小心,虚频就会更大。消除虚频的主要方法是改变构型。其次在计算上还可以尝试:qc;nosymm;加大maxcyc;提高conver;iop(1/8=1);gdiis;nolinear等。通常对于势能面很平,较小的虚频很难消除。 6-18 21:36
还可以改变初始波函数的猜测
5楼2009-06-18 17:04:42
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