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【求助】消除震荡
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请教下大家 对消除震荡有什么心得没?做一个东西 优化一次 老是在震荡 4个标准 都是NO 势能面比较平缓 大家对于这样的体系 有什么办法解决没? 对于势能面平缓的体系 怎么解决能加些什么命令 |
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zlding
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yuhuobuku(金币+8,VIP+0):欢迎交流 6-18 21:35
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在进行Gaussian计算时,经常会出现多个虚频个,每个都只有-30~-20左右,但是如果结构改动过大,则一不小心,虚频就会更大。消除虚频的主要方法是改变构型。其次在计算上还可以尝试:qc;nosymm;加大maxcyc;提高conver;iop(1/8=1);gdiis;nolinear等。通常对于势能面很平,较小的虚频很难消除。 为了解决以上的这种现象,按如下的步骤一步步调整: 1). 在优化时采用Scf(tight)的选项,增加收敛的标准。再去计算频率。如果还有虚频,参见下一步。 2). 对称性的影响,很多情况下的虚频是由于分子本身的对称性造成的。这样,在优化时,如果必要,要将对称性降低,还有,输入文件有时是用内坐标。建议如果有虚频的话,将内坐标改成直角坐标优化。但是有时这一方法也并没有多大作用。 3). 如果上述方法还有虚频,看一下虚频,找到强度较大的,将在频率中产生的原子的振动坐标加到相应的输入文件中。这样,重新计算。直到虚频没有。比较好的做法是分子结构输入用直角坐标,将这些产生虚频的振动坐标直接与原始坐标相加。加的时候不一定要将坐标直接相加,可以选择权重如1/3相加等。 4). 实际上,如果分子柔性较大,很难找到最低点,这是电子结构计算的问题,这种情况下,需要动力学的 东西,用构象搜寻的办法解决。如:模拟退火,最陡下降法,淬火法等。将得到的能量最低的构象做一般的电子结构计算,这样,应当没有问题。 5).如果上面几步仍然无法解决问题,则有可能是因为计算还没有得到最稳定的结构,那么或者是分子结构有问题,或者是计算错了,再者就是游离出现在计算的范畴。 [ Last edited by yjcmwgk on 2009-6-18 at 13:21 ] |
4楼2009-06-18 13:18:51
S07111072
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