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ml3029

木虫 (文坛精英)

[交流] 【求助】请问

各位大师，我没用过autodock,想问一下
1，
autodock的ligand的文件格式是XXX.dlg,怎么把3D结构转换为dlg文件？

2，还有怎么才能知道PBD文件的residue?

谢谢大家乐！
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读博毁一生
1楼 2009-06-18 08:45:49
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347383257

金虫 (小有名气)
★
ml3029(金币+1,VIP+0):我求助是想得到我不知道的知识，对不起，不需要你顶 6-20 16:09
没听说过，给你顶一下，呵呵
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风的方向有树决定，人生的方向需要自己决定。
2楼2009-06-18 08:53:00
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ml3029

木虫 (文坛精英)

哎呀

难道真的没人知道了吗
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读博毁一生
3楼2009-06-20 12:17:41
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 6-20 15:50
ml3029(金币+1,VIP+0):强 6-20 16:07
ml3029(金币+1,VIP+0):PBD的格式文档哪里有？能否给我一份 6-23 16:31
第一个问题，读 autodock 的说明文档

第二个问题，读 pdb 的格式文档

呵呵……
赞一下(12人) 回复此楼
4楼2009-06-20 14:03:14
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
pdb 的格式文档

http://www.wwpdb.org/documentation/format32/v3.2.html
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5楼2009-06-23 18:50:30
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
★ ★
ml3029(金币+2,VIP+0):谢谢啦，终于遇到高手了 6-24 07:41
引用回帖:
Originally posted by ml3029 at 2009/6/18 08:45:
各位大师，我没用过autodock,想问一下
1，
autodock的ligand的文件格式是XXX.dlg,怎么把3D结构转换为dlg文件？

2，还有怎么才能知道PBD文件的residue?

谢谢大家乐！

1.autodock的ligand文件格式不是.dlg，这是输出的文件格式。而输入的文件格式都是.pdbqt
2.是PDB，不是PBD；你用文本编辑器打开*.pdb文件，里边全是residue.......
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个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
6楼2009-06-23 22:00:17
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