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ml3029

木虫 (文坛精英)

[交流] 【求助】请问

各位大师,我没用过autodock,想问一下
1,
autodock的ligand的文件格式是XXX.dlg,怎么把3D结构转换为dlg文件?

2,还有怎么才能知道PBD文件的residue?

谢谢大家乐!
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读博毁一生
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347383257

金虫 (小有名气)


ml3029(金币+1,VIP+0):我求助是想得到我不知道的知识,对不起,不需要你顶 6-20 16:09
没听说过,给你顶一下,呵呵
风的方向有树决定,人生的方向需要自己决定。
2楼2009-06-18 08:53:00
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ml3029

木虫 (文坛精英)

哎呀

难道真的没人知道了吗
读博毁一生
3楼2009-06-20 12:17:41
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 6-20 15:50
ml3029(金币+1,VIP+0):强 6-20 16:07
ml3029(金币+1,VIP+0):PBD的格式文档哪里有?能否给我一份 6-23 16:31
第一个问题,读 autodock 的说明文档

第二个问题,读 pdb 的格式文档

呵呵……
4楼2009-06-20 14:03:14
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

5楼2009-06-23 18:50:30
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★ ★
ml3029(金币+2,VIP+0):谢谢啦,终于遇到高手了 6-24 07:41
引用回帖:
Originally posted by ml3029 at 2009/6/18 08:45:
各位大师,我没用过autodock,想问一下
1,
autodock的ligand的文件格式是XXX.dlg,怎么把3D结构转换为dlg文件?

2,还有怎么才能知道PBD文件的residue?

谢谢大家乐!

1.autodock的ligand文件格式不是.dlg,这是输出的文件格式。而输入的文件格式都是.pdbqt
2.是PDB,不是PBD;你用文本编辑器打开*.pdb文件,里边全是residue.......
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
6楼2009-06-23 22:00:17
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