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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

[交流] 如何在EBI上进行连个序列或者是三个序列的比对?

现在有两个测序结果的序列,想把这两个测序的序列和网上公布的序列比对一下,看看有没有什么区别,如果有区别的话想做个点突变,但是现在不会比对。我看很多文献中的序列比对,如果是相同,则下面有*,比如:
GCCAGTAACAAGACAATT
GCCAGTAACAAGACAACT
GCCAGTAACAAGACAATT
****************   *

这是如何弄出来的,我想请教一下大家,先提前谢谢了!
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Milanmy

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
jdklgjldg(金币+1,VIP+0):奖励,有EBI的网址或是压缩版的软件,请上传 6-17 21:50
把需比对的序列输入EBI的ClustalX中,前边加上>和序列名称,比对就可以了。下边是会有星号的。还可以下载到电脑中,用Bioedit查看。
7楼2009-06-17 21:41:02
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普通回帖

yuyixst

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
找个比对软件,比如DNAMAN,DNASTAR之类的
2楼2009-06-17 14:03:34
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

楼上正解,呵呵。clustalx或者Bioedit都可以的
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2009-06-17 17:06:18
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

还有那翻译成氨基酸后的比对呢?
4楼2009-06-17 17:46:13
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695

木虫 (职业作家)

Blast+ALIGNMENT,ok
5楼2009-06-17 18:13:59
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
翻译后的氨基酸序列也一样可以用上述软件比对
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
6楼2009-06-17 18:16:55
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

非常感谢Milanmy  ,感谢!
8楼2009-06-18 11:06:49
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

但是ClustalX中中只有一个输入框,但是我有三个测序的序列,难道是把这三个序列都输到这同一个框中吗?
9楼2009-06-18 11:09:26
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guyue2885

银虫 (正式写手)

dna MAN 足够用了
10楼2009-06-18 11:14:59
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