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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 如何在EBI上进行连个序列或者是三个序列的比对？
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

[交流] 如何在EBI上进行连个序列或者是三个序列的比对？

现在有两个测序结果的序列，想把这两个测序的序列和网上公布的序列比对一下，看看有没有什么区别，如果有区别的话想做个点突变，但是现在不会比对。我看很多文献中的序列比对，如果是相同，则下面有*，比如：
GCCAGTAACAAGACAATT
GCCAGTAACAAGACAACT
GCCAGTAACAAGACAATT
****************   *

这是如何弄出来的，我想请教一下大家，先提前谢谢了!
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1楼 2009-06-17 13:39:24
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Milanmy

银虫 (小有名气)
★ ★
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jdklgjldg(金币+1,VIP+0):奖励，有EBI的网址或是压缩版的软件，请上传 6-17 21:50
把需比对的序列输入EBI的ClustalX中，前边加上>和序列名称，比对就可以了。下边是会有星号的。还可以下载到电脑中，用Bioedit查看。
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7楼2009-06-17 21:41:02
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普通回帖

yuyixst

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
找个比对软件，比如DNAMAN，DNASTAR之类的
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2楼2009-06-17 14:03:34
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
楼上正解，呵呵。clustalx或者Bioedit都可以的
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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2009-06-17 17:06:18
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)
还有那翻译成氨基酸后的比对呢？
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4楼2009-06-17 17:46:13
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695

木虫 (职业作家)
Blast+ALIGNMENT,ok
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5楼2009-06-17 18:13:59
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
翻译后的氨基酸序列也一样可以用上述软件比对
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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
6楼2009-06-17 18:16:55
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)
非常感谢Milanmy  ，感谢！
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8楼2009-06-18 11:06:49
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)
但是ClustalX中中只有一个输入框，但是我有三个测序的序列，难道是把这三个序列都输到这同一个框中吗？
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9楼2009-06-18 11:09:26
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guyue2885

银虫 (正式写手)
dna MAN 足够用了
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10楼2009-06-18 11:14:59
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