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caiqingchong

木虫 (著名写手)

[交流] 还是基因敲除的问题(???)

现在构建一个敲除载体,用的是psup202,因为实在是没有合适的抗性标记可以再用了,因为菌株已经可以抗卡那霉素,而且需要转进去另一个抗性的质粒。

如图:我在AMP抗性基因内插入了要敲除基因的一段序列,然后在这段序列里面单切后又插入了AMP抗性基因(原来载体上的AMP插入失活了,再另插入这个基因,就又可以做筛选标记了,就是这么想的。注:没有别的抗性基因可选了。)。可是现在是每当连接新的amp基因后,总能转化出部分菌落,在amp抗性下长的很好,可提取质粒后大小完全不对,比预想的要小很多,这是怎么回事呢,难道,连接进去的amp基因把我连接到载体上的要敲除的基因序列给置换下来了吗,应该不会的吧?

大家分析下到底是怎么回事呢?
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tingl0087

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
"比预想的要小很多",是小了又插入的AMP基因吗?我也是最近才学习基因敲除,建议换个片段去插入失活原来的amp抗性基因。
5楼2009-06-21 19:00:01
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caiqingchong

木虫 (著名写手)

没人做过类似的吗?
2楼2009-06-18 09:14:06
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

我也做敲除,但是你的这个也还是不太明白,按理说应该会按你所设计的那样,但是结果截然相反我也不太清楚!
3楼2009-06-18 11:05:56
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我在AMP抗性基因内插入了要敲除基因的一段序列,然后在这段序列里面单切后又插入了AMP抗性基因?
还是不清楚你的思路...插入型敲除还是双交换?

[ Last edited by 克隆大虾 on 2009-6-18 at 04:13 ]
4楼2009-06-18 11:09:16
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