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realadamfir

银虫 (正式写手)

[求助] 求助!新版本squeeze如何操作 已有3人参与

使用最新版platon squeeze后生成01_sq.hkl   01_sq.ins  01_sq.lis   01_sqd.ins   01_sqd.sqf    01_sqd.sqz  01_sqd.hkl。之前我都是用sqd后缀的hkl和ins替换原有hkl及ins文件再精修,但是会出现Deprecated .res/.hkl Input Style SQUEEZE job这个错误。 如果sq的hkl和ins精修,ins里面含有abin命令,但是我用wingx shelxl会出现错误,无法精修!! 求各位晶体大神 新版本squeeze如何正确操作! 麻烦详细一点谢谢!我使用wingx shelxl精修。
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mistletoe
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夜霜天

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
推荐用olex2精修,生成的sqd文件可以删除,用sq.hkl、sq.ins精修。
olex2调用platon squeeze的时候,先把溶剂分子删掉然后refine一遍,把新生成的cif文件和fcf文件删掉,再点squeeze,一直按enter到最后生成sq.hkl和sq.ins,再olex2里打开sq.ins,hkl file选新生成的.sq.hkl文件继续精修。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2020-01-04 14:22:25
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
realadamfir: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2020-01-07 18:34:08
如果sq的hkl和ins精修,ins里面含有abin命令,但是我用wingx shelxl会出现错误,无法精修!!
这个是因为你的wingx里的精修程序需要更新一下,旧版的不支持abin命令,自然不能精修了
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
3楼2020-01-04 16:50:02
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
realadamfir: 金币+10, ★★★很有帮助 2020-01-07 18:33:40
本帖仅楼主可见
4楼2020-01-05 08:32:25
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realadamfir

银虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 夜霜天 at 2020-01-04 14:22:25
推荐用olex2精修,生成的sqd文件可以删除,用sq.hkl、sq.ins精修。
olex2调用platon squeeze的时候,先把溶剂分子删掉然后refine一遍,把新生成的cif文件和fcf文件删掉,再点squeeze,一直按enter到最后生成sq.hkl ...

谢谢

发自小木虫IOS客户端
mistletoe
5楼2020-01-07 18:34:27
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引用回帖:
4楼: Originally posted by lich666 at 2020-01-05 08:32:25
shelxl要是201x版本才行,没有就百度shelx,自己去那个网站上下载。

6楼2021-04-20 10:04:19
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hanwq744

木虫 (著名写手)

最后到底怎么解决的,我也一样的

发自小木虫IOS客户端
7楼2021-07-29 22:59:49
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