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coostudent

铜虫 (小有名气)

[交流] 2kb片段插入总是失败,搞了半年了,求前辈拯救

2kb片段插入质粒xbaI位点,酶切酶连还有in-fusion的方法都试过了,但是最终挑不到阳性克隆。搞了半年了,感觉就是个简单的酶切酶连操作,但就是搞不定,心累,想哭,求拯救!
除了质粒,相关的材料都换过了。质粒也对酶切位点周围测了序,没有问题,理论上也不会发生甲基化……
质粒是链霉菌基因编辑的商业化质粒pCRISPomyces-2 酶切位点XbaI
如需更详细线索 我会在后面补充

或者有做过相关试验的小伙伴吗,求指点!
多谢!

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coostudent

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
17楼: Originally posted by MerlingMay at 2020-05-04 17:20:00
你好,楼主,问题解决了么?我现在也在用in fusion克隆,其中一个把1.6kb的片段重组到3.6kb的载体上没问题,但是6kb的片段重组到载体上就有问题,平板上都是假阳性,酶切验证之后都是杂带。你有什么建议么???

之前的载体构建实验我暂时搁置了
不知你遇到的困难解决了没?
作为新手,我也提不出什么具体的建议……我知道的就是连接时载体和片段的比例,in-fusion同源部分的tm值最好相近,还有就是你酶切验证时提的质粒是不是有污染,导致切出来的可能不止你的质粒片段。
加油吧,共勉!
18楼2020-05-25 11:19:32
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ULYSSEESWB

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2020-01-18 20:29:13
in-fusion也失败?设置过阳性对照么?载体自连?试试pcr线性化载体

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2楼2020-01-02 13:15:50
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匿名


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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3楼2020-01-02 13:29:17
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狗狗狗尾巴草

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2020-01-18 20:29:22
实在不行试试双酶切吧,我们实验室基本都是双酶切。酶切连接失败我首先会检查扩增片段的引物上是否有相应的酶切位点及保护碱基;其次是质粒上确实具有这两个酶切位点序列(一定要在质粒上搜到相应的序列,有些质粒图谱画的不靠谱)。最后考虑试剂是否过期。祝你好运

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4楼2020-01-02 19:49:06
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