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coostudent

铜虫 (小有名气)

[交流] 2kb片段插入总是失败,搞了半年了,求前辈拯救

2kb片段插入质粒xbaI位点,酶切酶连还有in-fusion的方法都试过了,但是最终挑不到阳性克隆。搞了半年了,感觉就是个简单的酶切酶连操作,但就是搞不定,心累,想哭,求拯救!
除了质粒,相关的材料都换过了。质粒也对酶切位点周围测了序,没有问题,理论上也不会发生甲基化……
质粒是链霉菌基因编辑的商业化质粒pCRISPomyces-2 酶切位点XbaI
如需更详细线索 我会在后面补充

或者有做过相关试验的小伙伴吗,求指点!
多谢!

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liling0601

铜虫 (小有名气)


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引用回帖:
7楼: Originally posted by coostudent at 2020-01-03 14:48:36
in-fusion做了几次都失败了,最后转化涂板后在相应抗性环境下都能生长,应该是片段没插进去,最后载体自连,就是搞不懂为什么会自连的这么彻底
质粒10kb左右大小,pcr的话有什么pcr酶推荐么?
多谢答复!...

估计是你酶切的问题,PCR产物是割胶回收的吗?PCR时模板量要少一点,1-10ng,载体酶切之后涂板看看酶切的效果
13楼2020-01-17 15:31:44
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ULYSSEESWB

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2020-01-18 20:29:13
in-fusion也失败?设置过阳性对照么?载体自连?试试pcr线性化载体

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2楼2020-01-02 13:15:50
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匿名


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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3楼2020-01-02 13:29:17
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狗狗狗尾巴草

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2020-01-18 20:29:22
实在不行试试双酶切吧,我们实验室基本都是双酶切。酶切连接失败我首先会检查扩增片段的引物上是否有相应的酶切位点及保护碱基;其次是质粒上确实具有这两个酶切位点序列(一定要在质粒上搜到相应的序列,有些质粒图谱画的不靠谱)。最后考虑试剂是否过期。祝你好运

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2020-01-02 19:49:06
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