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zx53376876

木虫 (著名写手)

[交流] CIF 求助:希望大家都来帮忙!

SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   2.932
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT035_ALERT_1_A No _chemical_absolute_configuration info given .          ?
我这里有个化合物是P212121 的空间群,
在checkcif 的时候有如上的A错误,
1,Flack X 太大了,是2.932, 请问这个是怎么造成的,怎么才能修正?
2,CIF中没有绝对构型的信息,请问怎么才能填进去?是在ins文件中添加什么指令码?
还有就是:
3,在ins加什么指令才能在cif中把空间群和晶系直接加进去就不用在改cif文件了?

谢谢各位了!
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http://www.othello.cn/bbs/attachments/forumid_9/JY9e_1.gif
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
sanko211(金币+3,VIP+0):谢谢提供帮助,欢迎常来晶体版^_^ 6-10 12:18
这末多bb怎么不设一点给帮助者呢?   (开个玩笑)

SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   2.932
            Additional refinement cycles may be required.

结构还没收敛呢, 修, ls 25-30, 狠命地修

PLAT035_ALERT_1_A No _chemical_absolute_configuration info given .          ?

参看checkcif给的解释.  
应该是加 _chemical_absolute_configuration  UNK

我这里有个化合物是P212121 的空间群,
在checkcif 的时候有如上的A错误,
1,Flack X 太大了,是2.932, 请问这个是怎么造成的,怎么才能修正?

是不是没有> Si的较重原子? 那就决定不了绝对构型, 那要用merg 4把freidal pairs merg 掉, 再修, 然后 _chemical_absolute_configuration  UNK, 并把cif中的flack一行去掉.


2,CIF中没有绝对构型的信息,请问怎么才能填进去?是在ins文件中添加什么指令码?

好象没有这样的指令

还有就是:
3,在ins加什么指令才能在cif中把空间群和晶系直接加进去就不用在改cif文件了?


好象没有这样的指令
改也不麻烦嘛.
xi2004-emuch@163.com
2楼2009-06-10 11:15:50
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zx53376876

木虫 (著名写手)

我修了 800轮,还是不行啊 主要是H原子不收敛。
http://www.othello.cn/bbs/attachments/forumid_9/JY9e_1.gif
3楼2009-06-10 11:52:48
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

为何要修H? 毫无意义啊.
xi2004-emuch@163.com
4楼2009-06-10 16:12:32
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lizuoxi

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
waiy2001(金币+1,VIP+0):谢谢参与 6-10 16:48
引用回帖:
Originally posted by zx53376876 at 2009-6-10 11:52:
我修了 800轮,还是不行啊 主要是H原子不收敛。

可能是倚靠的非氢原子无序。
先把他处理好,再加氢
5楼2009-06-10 16:17:04
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zx53376876

木虫 (著名写手)

怎么才能不修H呢?
我的结构没有无序现象,
理论加的H,
但是就不H不收敛。
http://www.othello.cn/bbs/attachments/forumid_9/JY9e_1.gif
6楼2009-06-10 21:39:28
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
waiy2001(金币+1,VIP+0): 6-11 13:39
理论加的,不是都AFIX住了,怎么还会飘呢?
最不济还可以用AFIX 3, AFIX 1
xi2004-emuch@163.com
7楼2009-06-10 21:48:13
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sunshanqi

木虫 (著名写手)

菜鸟,路过
我不相信命运,我只相信我自己!!
8楼2009-06-10 22:50:54
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zx53376876

木虫 (著名写手)

哦,谢谢啦!
http://www.othello.cn/bbs/attachments/forumid_9/JY9e_1.gif
9楼2009-06-11 12:20:18
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wangzhuo9736

木虫 (正式写手)

不想修氢原子就把afix去掉.
10楼2009-06-13 16:13:29
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