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皓儿165

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】有个概念没明白

ONIOM-based method是什么方法啊,在文献中经常提到,看过ONIOM的介绍但还是没懂,ONIOM本身是结合的意思吧?哪位帮忙介绍下
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做个聪明优雅的女人
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)

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gwdavid(金币+2,VIP+0):3q 6-8 18:37
应该是分层计算了,手册上好像有,你看看吧
2楼2009-06-08 16:54:25
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★ ★
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yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎参加讨论 6-8 19:03
我想应该是onion吧,呵呵
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
3楼2009-06-08 18:37:36
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)

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yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎参加讨论 6-12 09:21
引用回帖:
Originally posted by gwdavid at 2009-6-8 18:37:
我想应该是onion吧,呵呵

不对,是multilayer oniom model

可以参考一下这个帖子,http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1370772&fpage=1
4楼2009-06-08 19:23:56
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)

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erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流,语句好像不通顺,嘿嘿 6-8 19:57
oniom是分层优化的方法,每层使用不同的基组。再结合出少稍微复杂点。
莫强求!
5楼2009-06-08 19:54:20
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皓儿165

铜虫 (正式写手)

谢谢楼上各位,分层优化应该效果更好一些吧
做个聪明优雅的女人
6楼2009-06-11 20:03:50
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皓儿165

铜虫 (正式写手)

我觉的这种方法可以好好学一下,应该比整个分子进行优化要精确一些
做个聪明优雅的女人
7楼2009-06-11 20:19:20
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rt3454l

至尊木虫 (小有名气)

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yuhuobuku(金币+2,VIP+0):欢迎参加讨论 6-12 09:21
ONIOM是分层计算,和赝势基组有些类似,只不过是相对于较大的分子或分子簇,内层的分子或较少参与反应的分子用小基组,而外层的或参与反应的分子用大的精确的基组去计算,一般ONIOM在药物分子计算中用的很多,不知道楼主是准备算些什么。
8楼2009-06-12 08:52:15
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皓儿165

铜虫 (正式写手)

我算的是由二三十个原子组成的有机分子,是不是更合适用oniom啊
做个聪明优雅的女人
9楼2009-06-15 11:53:23
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人

★ ★
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erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 6-15 16:56
有机分子直接计算就可以了。二三十个原子一般PC就可以做。
10楼2009-06-15 15:42:40
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