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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】80金币求助oniom的问题，需要您的解答（只要回复就给金币啦）{金币发完了}
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
半个月没人回答。放弃！还有75金币没发出去。现在，谁回复我就给谁金币
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11楼2009-07-02 20:16:58
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375642546

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
yjcmwgk(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+60,VIP+0):如你所愿，我不过了 7-2 20:29
如果中了一千万，我就去买 30 套房子租给别人，每天都去收一次房租。哇咔咔 ~~充实!
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12楼2009-07-02 20:27:47
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yuxuan1976

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+8,VIP+0):剩下的金币全给你了。 7-2 20:56
楼主算的东东好复杂，先佩服下！
帮你顶！
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13楼2009-07-02 20:44:53
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王中学

木虫 (正式写手)

海边拾贝的顽童
帮楼主顶
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君当如兰，幽谷长风，宁静志远
14楼2009-07-02 21:03:46
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王中学

木虫 (正式写手)

海边拾贝的顽童
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 7-3 14:12
yjcmwgk(金币+0,VIP+0):你真以为我不会看说明书啊？呵呵！ 8-12 09:40
建议楼主看看说明书，里面有的说
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君当如兰，幽谷长风，宁静志远
15楼2009-07-02 21:04:45
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azi9931

金虫 (著名写手)

小木虫----司令
呵呵，早说嘛
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对人随缘，对事随心！
16楼2009-07-02 21:08:18
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
引用回帖:
Originally posted by 王中学 at 2009-7-2 21:04:
建议楼主看看说明书，里面有的说

说明书关于oniom关键字的解释，我有N多木看懂的地方。我觉得我很可能是基础知识上的欠缺。
请问王中学懂吗？如果你能解答这些问题，我另开一个贴，给你200金币，行不？
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17楼2009-07-02 21:26:54
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liujodan

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
今天，做了个计算关于ONIOM 的，我的体系里边有Fe,自旋多重度，和电荷这些参数非常重要，但是我也没有搞明白，ONIOM里边的分层中的电荷，和自旋多重度，到底他们之间有没有联系，我的意思是Real 体系的自旋多重度是否与H或者L层的相关？他们的电荷又如何。今天，看到密度泛函的提出了这样的问题，感觉这个问题确实还是很难的。顶起此贴，希望达人解答！
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18楼2009-12-23 00:30:10
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张田雷

木虫 (正式写手)

为什么不分成两层呢？

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
为什么不分成两层呢？分成两层对应的电荷和多重度分别是整个体系的、高层的、底层的。 分层三层的以楼主的为例：整个体系的、高层的、中低层的、中层的 、低层的。
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实际一点现实一点多想一点认真一点安分一点淡定一点每天就会进步一点，长此以往总有一天你会到达你想要的高度。
19楼2010-01-03 10:43:28
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yongleli

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
对Link atom 的解释是，

分层之后，化学键不饱和。最简单的办法是堵上一个氢。
每个层单独计算的时候，其它层作为离散的背景电荷。
比如你的体系，中层的氮5有三价；但是作为中层，是以原子存在的。
为了模拟所在的化学环境，这个氮5必须连上2个原子。
默认连上两个氢。也可以增加，比如连C什么的。
然后多出来的氢在计算总能时减去。

E(N-C)=E(N-H)+E(H-C)-E(H2)之类的。
具体计算没有这么简单。算法见参考文献。

然后这个堵上的氢的键长、电荷等是参数，由程序重新定的。
可选的factor是用来改变这些参数的。用什么参数好需要看文献。
所以，如果对 N-C-H分三层的话，就是计算了这样三个体系：

N-H1, H1-C-H2, H2-H，然后总密度、能量什么的通过加加减减得到。

以上仅为大意。
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20楼2010-01-03 11:50:19
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