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duanjuko

银虫 (初入文坛)

[求助] 二维势能面扫描 已有1人参与

模拟乙醇的双质子迁移过程，形成H3O+离子
想通过势能面扫描找到过渡态，在输入文件里我写了两个键的扫描，为什么做出来只有一个键在扫描，无法做出二维的势能面呢？
输入文件内容如下，还麻烦前辈予以解答，感谢

%mem=800mb
%chk=c:\users\administrator\desktop\7848 scan.chk
# opt=modredundant ub3lyp/3-21g

7848

1 2
c                  1.25301900   -0.21453200    0.00000200
h                  2.06684200    0.51703000   -0.00001700
h                  1.35262400   -0.85227900   -0.88757500
h                  1.35263500   -0.85224600    0.88760200
c                 -0.05441600    0.51378900    0.00000100
h                 -0.20455700    1.20893300   -0.86899300
h                 -0.20456000    1.20896100    0.86896700
o                 -1.18318200   -0.38763100   -0.00000300
h                 -2.08914100    0.07510400    0.00002600

b 7 8 s 10 -0.206443
b 4 8 s 10 -0.272655
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1楼 2019-10-06 13:15:46
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duanjuko

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-10-07 00:32:21
应该是没有扫完中间就出错了 所以只能看到几个点。 很明显的就是 这是要扫描4 和 8 之间的 7 和 8 之间的距离  从你的初始坐标来看 他们分别相距2.72A 和 2.06A  也就说 这个扫描是要从现有的原子间距离距离上扫描到 ...

十分感谢您的回复
我调整了扫描范围，跑完还是会不收敛，也就是第一个H转移到OH这个基团后，第二个H还没有转移过去就碎开了
通过势能面扫描的办法似乎无法找到形成H3O+离子的过渡态
赞一下 回复此楼
3楼2019-10-08 14:41:45
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与，应助指数 +1
duanjuko: 金币+30, ★★★很有帮助 2019-10-08 18:37:15
duanjuko: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2019-10-10 21:12:43
应该是没有扫完中间就出错了 所以只能看到几个点。 很明显的就是 这是要扫描4 和 8 之间的 7 和 8 之间的距离  从你的初始坐标来看 他们分别相距2.72A 和 2.06A  也就说 这个扫描是要从现有的原子间距离距离上扫描到0 埃。 这肯定是不可能的实现的。O---H之间的距离 不会小于0.8A左右的  所以应该是 扫到这个地方就会停掉。因为根本收敛不了。扫描键长跟角度不一样 是有最小值的。是不能扫到0的。
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2楼2019-10-07 00:32:21
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M小c

银虫 (小有名气)
试一试先扫描一个键的
再接着扫描另一个键？
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物含妙理总堪寻
4楼2019-10-08 18:33:10
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