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二维势能面扫描已有1人参与
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模拟乙醇的双质子迁移过程，形成H3O+离子 想通过势能面扫描找到过渡态，在输入文件里我写了两个键的扫描，为什么做出来只有一个键在扫描，无法做出二维的势能面呢？ 输入文件内容如下，还麻烦前辈予以解答，感谢 %mem=800mb %chk=c:\users\administrator\desktop\7848 scan.chk # opt=modredundant ub3lyp/3-21g 7848 1 2 c 1.25301900 -0.21453200 0.00000200 h 2.06684200 0.51703000 -0.00001700 h 1.35262400 -0.85227900 -0.88757500 h 1.35263500 -0.85224600 0.88760200 c -0.05441600 0.51378900 0.00000100 h -0.20455700 1.20893300 -0.86899300 h -0.20456000 1.20896100 0.86896700 o -1.18318200 -0.38763100 -0.00000300 h -2.08914100 0.07510400 0.00002600 b 7 8 s 10 -0.206443 b 4 8 s 10 -0.272655 |
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paramecium86
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
duanjuko: 金币+30, ★★★很有帮助 2019-10-08 18:37:15
duanjuko: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2019-10-10 21:12:43
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| 应该是没有扫完中间就出错了 所以只能看到几个点。 很明显的就是 这是要扫描4 和 8 之间的 7 和 8 之间的距离 从你的初始坐标来看 他们分别相距2.72A 和 2.06A 也就说 这个扫描是要从现有的原子间距离距离上扫描到0 埃。 这肯定是不可能的实现的。O---H之间的距离 不会小于0.8A左右的 所以应该是 扫到这个地方就会停掉。因为根本收敛不了。扫描键长跟角度不一样 是有最小值的。是不能扫到0的。 |
2楼2019-10-07 00:32:21
3楼2019-10-08 14:41:45
4楼2019-10-08 18:33:10