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qustwq

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】20金币急求!!surflex-dock中怎样给每个产生protomol的探针分子打分?

急求急求!!surflex中怎样设置可以给每一个产生protomol的探针打分?或是在哪查看每个探针的得分?

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 13:58 ]
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syhu_007012

木虫 (正式写手)


qustwq(金币+1,VIP+0):谢谢你! 6-5 09:16
不知道  帮你顶吧
2楼2009-06-04 15:08:58
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★ ★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-4 20:06
qustwq(金币+1,VIP+0):谢谢!请问在sybyl里哪一模块可以给出蛋白周围探针与它相互作用的得分呢? 6-5 09:19
这个应该做不到吧
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
3楼2009-06-04 15:09:42
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qustwq

木虫 (正式写手)

请推荐一个可以查看蛋白周围探针的得分软件吧!
4楼2009-06-05 09:23:40
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liugenyan

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-10 10:55
qustwq(金币+1,VIP+0): 7-15 22:02
surflex中怎样设置可以给每一个产生protomol的探针打分?或是在哪查看每个探针的得分?

为什么要这么做呢,我用SYBYL好久了没有这么做过
5楼2009-07-07 23:07:51
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winterose_

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 7-10 16:38
qustwq(金币+1,VIP+0):谢谢! 7-15 22:02
我揣测了半天楼主的意图,大胆询问下不会是为了观察口袋的环境吧...?
那样的话可以有其它更好的办法.
当然,我自猜自想,可能八竿子打不着,那样的话楼主就直接忽略这贴吧...
6楼2009-07-10 15:32:48
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杞实很简单

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 7-12 17:49
qustwq(金币+2,VIP+0): 7-15 22:02
我也用了syby快两年了,使用surflex也有一段时间了。我做这个的时候没有考虑过这个问题,无法给楼主直接解答。我自己认为,这个模块没有涉及到给产生的protomol进行打分的功能。个人认为可以比较protomol与受体蛋白质原来自带的配体,通过比较这两者的相关性,可以在一定程度上评价程序产生的protomol优劣。
个人愚见,尽情拍砖。
7楼2009-07-12 15:45:50
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