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466902981

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】【求助】怎么看MD的全部输出结果

怎么看MD的全部输出结果啊?包括cell的变化,原子的坐标,压力,密度等等参数,从哪里看啊?多谢了!
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466902981

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by Minicheung at 2009-6-3 11:04:
先请问,你都计算了一些什么啊

用npt方法在一定温度T和压力P下做了MD,轨迹文件保存方式选择的是full,想看到体系在外加压力下的变化情况,所以我想要Cell的变化情况,原子坐标的变化输出,不知道怎么实现,请朋友帮忙!
3楼2009-06-03 11:16:26
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Minicheung

至尊木虫 (职业作家)


466902981(金币+1,VIP+0):多谢! 6-3 11:11
先请问,你都计算了一些什么啊
2楼2009-06-03 11:04:43
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abinitio

版主 (著名写手)


466902981(金币+1,VIP+0):多谢! 6-3 14:38
用的是那个模块?
应该会有个.out文件,里面就是输出的值。
4楼2009-06-03 14:15:14
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466902981

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by abinitio at 2009-6-3 14:15:
用的是那个模块?
应该会有个.out文件,里面就是输出的值。

我用的是discover 模块,但.out 文件中的输出很少,比如cell的大小只是动力学开始时的参数,而变化的情况怎么看呢?多谢了!
5楼2009-06-03 14:40:26
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