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新的自我100

金虫 (初入文坛)

[求助] 转录组数据

从转录组测序结果中筛出一条序列只有700多bp，现在想要克隆，但是在NCBI的BLAST中比对不到任何序列，我要怎么获得其完整开放阅读框进行克隆，谢谢。
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1楼 2019-09-07 21:03:41
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zxd95

至尊木虫 (著名写手)
使用5’RACE和3’RACE技术扩增目的基因的全长。

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追梦的人
2楼2019-09-08 00:32:37
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-11-22 22:31:59
通过race技术，最常用的，先克隆出700bp核心序列，然后买race试剂盒。

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3楼2019-09-08 16:22:45
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婉柳

新虫 (小有名气)
你是怎么解决的这个问题，我从转录组测序结果里，筛出来的序列有1000多bp,也是在NCBI的BLAST里比对到的序列很少，用OPFfinder预测开放阅读框，最长的只有130bp左右,这样的序列，怎样设计引物，获得开放阅读框进行克隆。没人带着做前边的生信分析，真的好难呀

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4楼2019-11-22 18:20:05
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温柔的小笛子

新虫 (正式写手)
RACE试剂盒可以

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5楼2020-01-24 14:59:15
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