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Dexian_Ma

银虫 (小有名气)

[求助] 关于NAMD tclBC设置固定边界条件,请问有大神了解嘛?

建立了一个氮化硅薄板,给其在溶液中加了一个电场,想看离子流把它冲溃的样子。可是每次快要击溃的时候总是报错,应该是体系崩溃了没法继续往下算了,所以想问一下,有没有什么办法可以使其报错了之后还能接着算???


目前了解到的一个方法就是设置固定边界条件,使得它原子到边界会反弹回来。听说使用TCLBC好像可以实现,请问有大神了解怎么做嘛?


报的错都是这种:FATAL ERROR: Low global exclusion count!  (53300 vs 53301)  System unstable or pairlistdist or cutoff too small.
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moirakaola

银虫 (小有名气)

楼主,你好!请问你的氮化硅的模型是怎么样的,可以上传图片吗?边界处的原子是怎么处理的呢?希望你的问题顺利解决!
2楼2019-10-08 09:46:12
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