应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】ＤＳ在跑动力学的时候可以看到中间过程的轨迹么？
131/2返回列表12下一页
查看: 1100  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...

[交流] 【求助】ＤＳ在跑动力学的时候可以看到中间过程的轨迹么？

在跑得这个结构比较大，所以算了很长时间还没结束。现在CPU确实在占用资源，但怕是假象（因为以前用Gaussian的时候明明不在算cpu也显示占用50%）。DS的out文件里面没有任何文件，请问这个软件在计算过程中不临时保存轨迹的吗？我要怎么判断DS是不是真的在跑呢？（除了看CPU）。
请大侠指教，万分感激.
还有如果我不小心关掉程序的话，可不可以继续算下去呢？

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:23 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
1楼 2009-06-01 11:13:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongbinz

金虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
yyx19840628(金币+2,VIP+0):谢谢 6-1 14:15
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-8 22:33
没有做过这个方面的，不过应该不可以吧，你停止这个程序的时候，系统会提醒你是否删掉你做的工作，不过，你可试试用其它没有用的程序停止，看会不会有影响哈！
赞一下(11人) 回复此楼
2楼2009-06-01 11:42:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

童心

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 6-19 11:50
Job在运行的时候，不是有running或者success（表示ok了），或error的标识吗？而且你若要保存中间轨迹文件，需要在prference里面protocol选项中选择save intermediate files。这样就算中间断电也是可以重新接着运行的。
赞一下(10人) 回复此楼
3楼2009-06-19 11:14:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maitianhao

金虫 (小有名气)
应该不行，我也没做过
赞一下 回复此楼
4楼2009-06-20 15:47:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

香奈儿3182

铜虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
yyx19840628(金币+2,VIP+0):打不开啊 7-8 16:28
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-8 22:33
你可以在C:/-program files/scitegic/web/jobs/user中看，但一定要在运行时。
dcd格式是看轨迹的
赞一下(11人) 回复此楼
5楼2009-07-08 14:48:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-10 10:13
好象WINDOWS版能实时看到能量等变化曲线。
赞一下(10人) 回复此楼
6楼2009-07-08 15:10:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
引用回帖:
Originally posted by yytsnake at 2009-7-8 15:10:
好象WINDOWS版能实时看到能量等变化曲线。

你说的好像是MS中的Discovery
赞一下 回复此楼
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
7楼2009-07-08 16:23:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qixingbao07

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 7-10 10:14
DS在跑的过程中是不能看的，并且DS还占内存很大
赞一下(10人) 回复此楼
8楼2009-07-09 08:11:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
还好啊，比MS里面的ds快多了
赞一下 回复此楼
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
9楼2009-07-09 15:20:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

童心

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-8 22:33
yyx19840628(金币+1,VIP+0):为什么我的出现erro也没有东西——设置里面勾选保存中间数据的。 8-18 19:40
运算中output里面是没有东西的，就算你设置了保存中间文件，只有出现error或者success的时候才可以
赞一下(10人) 回复此楼
10楼2009-08-08 21:08:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yyx19840628 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:40 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:10 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:07 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 03:59 by Z7qfCsdIiD1T
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:54 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-11 01:24 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 5/250 2026-11-11 00:59 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 4/200 2026-11-10 22:39 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-10 20:12 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 4/200 2026-11-10 20:07 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 申请环境，微生物方向博士 +3 浅笑09 2026-11-08 3/150 2026-11-10 12:44 by 可淡不可忘
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭