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zmcwangyang铁杆木虫 (著名写手)
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[求助]
做分子对接的蛋白结构如何选择？ 已有2人参与
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| 新人求助，做分子对接时，在PDB数据库中搜索蛋白，遇到同一个蛋白具有多个结构的情况，比如NR5A2具有1YOK、1YUC、3PLZ等多种结构，该选择哪个结构来进行分子对接，选择的理由是什么？求助各位大神，谢谢 |
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【答案】应助回帖
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zmcwangyang: 金币+3, ★有帮助 2019-08-16 15:57:53
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| 需要先了解这些所解析的晶体结构是否已经包含了拟对接分子的潜在结合位点，还需注意晶体结构中蛋白序列是否为野生型、是否含有PTM、是否存在有可能引起构象变化的特殊有机溶剂和别构效应分子等。如果系列晶体结构的性质都类似，选择分辨率最高的。 |
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zmcwangyang2楼2019-08-15 08:08:38
zmcwangyang
铁杆木虫 (著名写手)
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3楼2019-08-15 17:02:36
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